More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5458 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5458  ABC transporter related  100 
 
 		 416 aa  806    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  56.75 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  55 
 
 		 375 aa  350  2e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  54.27 
 
 		 375 aa  344  2e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.44 
 
 		 376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  50.62 
 
 		 409 aa  342  7e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  55.84 
 
 		 374 aa  342  9e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  56.02 
 
 		 371 aa  342  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  56.62 
 
 		 375 aa  341  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  57.36 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  49.29 
 
 		 408 aa  336  5e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  56.1 
 
 		 357 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  48.35 
 
 		 398 aa  335  9e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  49.15 
 
 		 380 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  56.52 
 
 		 360 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.35 
 
 		 379 aa  332  6e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  51.15 
 
 		 416 aa  331  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  48.71 
 
 		 398 aa  331  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  42.86 
 
 		 367 aa  331  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  42.86 
 
 		 367 aa  331  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.14 
 
 		 361 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  52.83 
 
 		 364 aa  329  6e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  54.74 
 
 		 378 aa  328  9e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  53.68 
 
 		 368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  47.34 
 
 		 405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  47.34 
 
 		 405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  47.1 
 
 		 405 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  56.83 
 
 		 388 aa  325  1e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  47.96 
 
 		 406 aa  324  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.57 
 
 		 349 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  48.07 
 
 		 393 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  50.47 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  50.43 
 
 		 370 aa  324  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  54.41 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  46.87 
 
 		 410 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  52.63 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  48.42 
 
 		 404 aa  323  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  43.96 
 
 		 363 aa  322  6e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  46.49 
 
 		 380 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46.47 
 
 		 369 aa  322  7e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  46.17 
 
 		 362 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  54.04 
 
 		 364 aa  322  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  55.11 
 
 		 363 aa  322  8e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.57 
 
 		 349 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  47.55 
 
 		 356 aa  322  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  51.15 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  53.68 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  53.99 
 
 		 381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  42.89 
 
 		 426 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.62 
 
 		 349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  56.31 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  52.16 
 
 		 356 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  48.06 
 
 		 399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  52.68 
 
 		 372 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  46.42 
 
 		 360 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 364 aa  319  7e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  53.8 
 
 		 358 aa  319  7e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  55.97 
 
 		 361 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  55.97 
 
 		 361 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  45.5 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  53.02 
 
 		 355 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  52.29 
 
 		 393 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  45.5 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  52.48 
 
 		 367 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  56.48 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  52.86 
 
 		 368 aa  317  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  45.21 
 
 		 372 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  56.82 
 
 		 370 aa  316  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  50.77 
 
 		 384 aa  316  5e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  53.16 
 
 		 360 aa  316  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  53.54 
 
 		 370 aa  316  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  47.19 
 
 		 398 aa  315  7e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.63 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  52.05 
 
 		 358 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  41.16 
 
 		 369 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  55.91 
 
 		 366 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  47.62 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5207  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.52 
 
 		 348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.575313 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  51.51 
 
 		 362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.54 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  52.71 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  48.45 
 
 		 369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  50 
 
 		 351 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 		 406 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.6 
 
 		 360 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 375 aa  312  6.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  52.62 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.4 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.4 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  50.33 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  55.29 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  42.17 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.4 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  51.43 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  44.88 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.3 
 
 		 364 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.09 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  47.86 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>