More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2551 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2551  ABC transporter related  100 
 
 
347 aa  671    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2402  ABC transporter related  89.15 
 
 
351 aa  567  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  48.9 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  45.56 
 
 
352 aa  301  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  47.71 
 
 
361 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  46.33 
 
 
356 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  48.29 
 
 
361 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  44.19 
 
 
353 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  49.12 
 
 
346 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.46 
 
 
356 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  50 
 
 
374 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.46 
 
 
356 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  49.12 
 
 
346 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.46 
 
 
356 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 
356 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.44 
 
 
365 aa  295  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  46.35 
 
 
351 aa  295  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.18 
 
 
356 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5579  ABC transporter related  47.16 
 
 
361 aa  295  8e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.82 
 
 
351 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  46.39 
 
 
368 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.28 
 
 
376 aa  293  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  44.63 
 
 
366 aa  292  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.17 
 
 
369 aa  291  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2735  ABC transporter related  49.43 
 
 
370 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0804319  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  43.45 
 
 
385 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  46.26 
 
 
368 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  44.14 
 
 
372 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.56 
 
 
365 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.56 
 
 
365 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  48.51 
 
 
338 aa  290  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  47.73 
 
 
344 aa  289  6e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  44.48 
 
 
380 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  41.37 
 
 
363 aa  288  9e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
362 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  44.1 
 
 
362 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  44.23 
 
 
371 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 
381 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  47.41 
 
 
351 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.82 
 
 
349 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.75 
 
 
367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.58 
 
 
364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  44.35 
 
 
368 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  43.32 
 
 
379 aa  286  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  46.43 
 
 
365 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.5 
 
 
365 aa  286  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 
386 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  47.58 
 
 
357 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  44.63 
 
 
355 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  45.28 
 
 
364 aa  286  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.24 
 
 
351 aa  286  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.31 
 
 
349 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.26 
 
 
349 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  45.45 
 
 
368 aa  286  5e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  45.48 
 
 
335 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  44.97 
 
 
371 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.35 
 
 
351 aa  285  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  43.1 
 
 
353 aa  285  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.39 
 
 
362 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  44.71 
 
 
371 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  41.62 
 
 
373 aa  285  9e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  48.02 
 
 
325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.26 
 
 
360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.92 
 
 
369 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.03 
 
 
349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  45.77 
 
 
335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  46.97 
 
 
382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  44.05 
 
 
370 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.26 
 
 
360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  46.18 
 
 
360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  45.33 
 
 
360 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  45.98 
 
 
371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  45.87 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  54.55 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.3 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  45.14 
 
 
371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  45.06 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  44.63 
 
 
366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  43.65 
 
 
367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  44.13 
 
 
366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  40.96 
 
 
364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.38 
 
 
357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.7 
 
 
349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.92 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.38 
 
 
357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  44.72 
 
 
371 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  45.98 
 
 
360 aa  282  6.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  46.11 
 
 
352 aa  282  6.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 
369 aa  282  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.51 
 
 
375 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  43.61 
 
 
365 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  44.79 
 
 
368 aa  282  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  42.82 
 
 
369 aa  282  7.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  46.54 
 
 
363 aa  282  7.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  42.9 
 
 
372 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  47.18 
 
 
350 aa  282  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.41 
 
 
352 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  45.93 
 
 
333 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  44.44 
 
 
371 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  45.35 
 
 
356 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>