More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11887 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  100 
 
 
369 aa  724    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  63.91 
 
 
358 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  63.91 
 
 
358 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  63.91 
 
 
358 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3861  ABC transporter related  56.32 
 
 
358 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2536  ABC transporter-related protein  55.8 
 
 
359 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  55.56 
 
 
346 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  48.91 
 
 
372 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  52.51 
 
 
371 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  48.51 
 
 
367 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  47.17 
 
 
358 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  45.11 
 
 
352 aa  237  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.79 
 
 
343 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  42.02 
 
 
402 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  44.53 
 
 
361 aa  226  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  41.55 
 
 
384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  41.32 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4507  ABC transporter related protein  43.06 
 
 
367 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.462419  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  43.9 
 
 
347 aa  220  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4175  ABC transporter related  51.98 
 
 
391 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1233  ABC transporter related  48.23 
 
 
361 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.642029  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  42 
 
 
354 aa  210  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  45.09 
 
 
350 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  41.88 
 
 
354 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  38.86 
 
 
385 aa  195  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  41.23 
 
 
349 aa  189  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  38.22 
 
 
344 aa  186  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
343 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2304  ABC transporter related protein  50.41 
 
 
335 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  39.32 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  38.89 
 
 
372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  31.5 
 
 
347 aa  172  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  40.17 
 
 
372 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  39.68 
 
 
377 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  37.66 
 
 
360 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2873  ABC transporter related  42.57 
 
 
353 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.204327 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.88 
 
 
377 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
349 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  38.46 
 
 
360 aa  170  4e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1601  ABC transporter related protein  39.47 
 
 
358 aa  170  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  40.07 
 
 
359 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 
363 aa  169  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  40.07 
 
 
368 aa  169  8e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1851  ABC transporter related  45.02 
 
 
219 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0521462 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0621  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.19 
 
 
348 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0827201  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  43.97 
 
 
352 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  39.56 
 
 
363 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1819  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  33.06 
 
 
353 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147813  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.44 
 
 
366 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0701  sulfate ABC transporter ATP-binding protein  42.19 
 
 
348 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  40.08 
 
 
354 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  40.15 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6541  ABC transporter related  40.44 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131089 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  41.52 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  48.29 
 
 
247 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  40.43 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  40.59 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  34.72 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  30.64 
 
 
348 aa  166  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2120  spermidine/putrescine import ATP-binding protein  39.67 
 
 
376 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  37.05 
 
 
354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  34.84 
 
 
361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5570  ABC transporter related protein  41.33 
 
 
365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2551  ABC transporter related  43.21 
 
 
347 aa  166  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4565  ABC transporter related  41.88 
 
 
361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  33.44 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  39.26 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  37.99 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  41.52 
 
 
336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  39.68 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  34.83 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  34.29 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  39.08 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2659  ABC transporter related  38.53 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 
346 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2939  ABC transporter ATP-binding protein  37.41 
 
 
358 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.878604  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0256  ABC transporter related  39.22 
 
 
367 aa  164  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 
353 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.97 
 
 
387 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  41.38 
 
 
363 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.55 
 
 
378 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.55 
 
 
378 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.55 
 
 
378 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.11 
 
 
356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  37.72 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2869  ABC transporter related  37.41 
 
 
361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0665765 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  36.86 
 
 
369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1864  ABC transporter related  34.39 
 
 
361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1796  ABC transporter related  36.97 
 
 
393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165895  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1080  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  40.08 
 
 
352 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5239  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.08 
 
 
380 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.56 
 
 
408 aa  163  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.07 
 
 
379 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5179  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  37.66 
 
 
380 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2120  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.82 
 
 
380 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674614  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3216  ABC transporter related  37.41 
 
 
361 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.13 
 
 
378 aa  162  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>