More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0256 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0256  ABC transporter related  100 
 
 		 367 aa  759    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1484  ABC transporter related  45.83 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.69 
 
 		 604 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.69 
 
 		 604 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2196  ABC transporter related  45.98 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.445152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  41.13 
 
 		 602 aa  266  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03870  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  41.34 
 
 		 370 aa  262  8e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  43.27 
 
 		 601 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0330  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.48 
 
 		 628 aa  256  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01620  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  41.8 
 
 		 371 aa  255  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.98 
 
 		 615 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.22 
 
 		 616 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1441  ABC transporter related  39.3 
 
 		 342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  33.03 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  32.73 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  32.73 
 
 		 380 aa  192  9e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  42.92 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  35.57 
 
 		 360 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  34.48 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  43.67 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  45.25 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1368  ABC transporter related  40.87 
 
 		 385 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.101155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  37.73 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  43.84 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1571  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 330 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0395  ABC transporter related  40.37 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  43.23 
 
 		 342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  40.45 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 330 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 		 318 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 330 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 		 318 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 330 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  42.04 
 
 		 369 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  39.78 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0279  ABC transporter related  42.29 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000167644 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3742  ABC transporter related  42.29 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.76 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  39.63 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4452  ABC transporter related  35.63 
 
 		 380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  41.15 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  43.04 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0283  ABC transporter related  40.57 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 		 330 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  42.01 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0287  ABC transporter related  40.57 
 
 		 367 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0290  ABC transporter related  40.57 
 
 		 367 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3531  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4042  ABC transporter related  41.05 
 
 		 360 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3591  ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 		 330 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  40.09 
 
 		 349 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0280  ABC transporter related  41.85 
 
 		 367 aa  179  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000359187 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  40.09 
 
 		 349 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1601  ABC transporter related protein  35.03 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.65 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  39.64 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  43.46 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  43.75 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.65 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  41.13 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4786  ABC transporter related  38.08 
 
 		 368 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00107272  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  39.64 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  39.83 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.28 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.61 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  36.59 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  36.23 
 
 		 352 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  42.74 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0375  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.89 
 
 		 426 aa  176  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 		 244 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  41.41 
 
 		 353 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 346 aa  175  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  41.41 
 
 		 353 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  36.36 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  41.94 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4446  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  41.05 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.35 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.52 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5129  ABC transporter related  42.22 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  43.78 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7192  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.2 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  42.67 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00458  ATP-binding component of putrescine transport system  42.68 
 
 		 419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0033874  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  45.41 
 
 		 368 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1822  ABC transporter related  42.98 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.59 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  39.3 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  49.49 
 
 		 354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6023  ABC transporter-related protein  38.65 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>