More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0569 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0632  ABC transporter related  78.24 
 
 		 240 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225775  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05462  ABC transporter ATP-binding protein  61.02 
 
 		 245 aa  294  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4221  ABC transporter related  59.83 
 
 		 247 aa  291  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4331  ABC transporter related  59.83 
 
 		 247 aa  291  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  0.0395621 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  63.18 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  63.18 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  63.18 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  63.18 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  63.18 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  63.18 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  63.18 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0591  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  61.82 
 
 		 233 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4506  ABC transporter related  58.16 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3669  ABC transporter related  58.16 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3858  ABC transporter related  58.16 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  57.32 
 
 		 233 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3755  ABC transporter related  59.01 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.140303 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3226  ABC transporter related  59.01 
 
 		 247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  59.82 
 
 		 233 aa  278  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2850  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  58.9 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6806  ABC transporter related  57.99 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000478564 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4403  ABC transporter related  57.99 
 
 		 233 aa  268  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.193206  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2578  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  55.45 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3696  ABC transporter related  47.95 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2226  ABC transporter related  47.96 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 		 366 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2789  ABC transporter related  47.98 
 
 		 253 aa  208  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1579  ABC transporter related  47.81 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4068  ABC transporter related  47.96 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2477  ABC transporter related  45.95 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  46.43 
 
 		 380 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  44.64 
 
 		 380 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  40.55 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0412  ABC transporter related  46.53 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00532109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1441  ABC transporter related  45.32 
 
 		 342 aa  190  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2196  ABC transporter related  44.89 
 
 		 370 aa  189  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.445152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1481  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  47.06 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  44.18 
 
 		 380 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  41.4 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1484  ABC transporter related  40.09 
 
 		 391 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.75 
 
 		 628 aa  180  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01620  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  41.1 
 
 		 371 aa  179  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  44.23 
 
 		 289 aa  178  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  41.26 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 		 604 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0256  ABC transporter related  45.45 
 
 		 367 aa  176  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  41.89 
 
 		 602 aa  175  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 		 604 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  44 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03870  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  43.3 
 
 		 370 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 		 359 aa  172  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  39.01 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 		 368 aa  171  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1601  ABC transporter related protein  46.43 
 
 		 358 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.88 
 
 		 367 aa  170  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4558  ABC transporter related  40.93 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1739  ABC transporter related  41.2 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.815071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.61 
 
 		 616 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.36 
 
 		 367 aa  168  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  47.21 
 
 		 385 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  47.62 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  44.9 
 
 		 378 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  39.7 
 
 		 329 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.27 
 
 		 363 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1923  ABC transporter related  47.59 
 
 		 374 aa  164  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  40 
 
 		 336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  41.36 
 
 		 398 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  42.93 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  43.52 
 
 		 289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0211  ATPase  42.58 
 
 		 352 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  43.01 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  41.95 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  44.68 
 
 		 356 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2630  ABC transporter related  41.56 
 
 		 378 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0792503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.3 
 
 		 379 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0170  ABC transporter related  48.05 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  41.5 
 
 		 360 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  44.5 
 
 		 601 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  41.71 
 
 		 323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1531  ABC transporter related  43.24 
 
 		 211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.952965  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.3 
 
 		 355 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4395  ABC transporter-related protein  39.44 
 
 		 369 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  hitchhiker  0.0000262843 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  42.19 
 
 		 375 aa  161  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0507  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 353 aa  161  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0330  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.34 
 
 		 615 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 355 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 355 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 355 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0892  ABC transporter related  36.82 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.494733  normal  0.0891232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  41.1 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  43.3 
 
 		 389 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 355 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 355 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  46.56 
 
 		 355 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  45.21 
 
 		 369 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 355 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  41.67 
 
 		 373 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>