More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6806 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6806  ABC transporter related  100 
 
 
233 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000478564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2850  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  91.42 
 
 
233 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4403  ABC transporter related  81.82 
 
 
233 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.193206  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3226  ABC transporter related  72.81 
 
 
247 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3755  ABC transporter related  72.37 
 
 
247 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.140303 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0591  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  70.56 
 
 
233 aa  333  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  71.62 
 
 
233 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  71.62 
 
 
233 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  71.62 
 
 
233 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  71.62 
 
 
233 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  71.62 
 
 
233 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  71.62 
 
 
233 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  71.62 
 
 
233 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4506  ABC transporter related  70.61 
 
 
233 aa  331  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3669  ABC transporter related  70.61 
 
 
233 aa  331  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3858  ABC transporter related  70.61 
 
 
233 aa  331  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447489  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  70.18 
 
 
233 aa  330  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  70.61 
 
 
233 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0632  ABC transporter related  60.27 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225775  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05462  ABC transporter ATP-binding protein  60.81 
 
 
245 aa  275  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4331  ABC transporter related  60.65 
 
 
247 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  0.0395621 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4221  ABC transporter related  60.65 
 
 
247 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  57.99 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2226  ABC transporter related  58.56 
 
 
222 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248839  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2578  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  57.99 
 
 
261 aa  262  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3696  ABC transporter related  50.23 
 
 
239 aa  231  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2789  ABC transporter related  51.13 
 
 
253 aa  215  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1481  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  51.13 
 
 
263 aa  214  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2477  ABC transporter related  49.1 
 
 
260 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1579  ABC transporter related  48.85 
 
 
259 aa  203  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4068  ABC transporter related  48.89 
 
 
264 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  46.26 
 
 
366 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 
385 aa  191  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  44.29 
 
 
213 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0412  ABC transporter related  47.17 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00532109  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  40.17 
 
 
380 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1484  ABC transporter related  41.18 
 
 
391 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  39.74 
 
 
380 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1441  ABC transporter related  40.74 
 
 
342 aa  176  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  40.61 
 
 
380 aa  175  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 
368 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  41.92 
 
 
602 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.55 
 
 
604 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01620  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  41.07 
 
 
371 aa  170  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1601  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
358 aa  168  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.06 
 
 
604 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.7 
 
 
628 aa  166  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  46.48 
 
 
352 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 
357 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.78 
 
 
359 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0330  ABC transporter related protein  35.94 
 
 
349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1739  ABC transporter related  37.56 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.815071  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  36.48 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2196  ABC transporter related  42.53 
 
 
370 aa  163  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.445152  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  37.84 
 
 
290 aa  162  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.38 
 
 
352 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  39.51 
 
 
329 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0256  ABC transporter related  41.55 
 
 
367 aa  161  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.03 
 
 
368 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  36.96 
 
 
289 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0452  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.85 
 
 
350 aa  158  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  43.16 
 
 
405 aa  158  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  43.2 
 
 
241 aa  158  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 
615 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  43.72 
 
 
363 aa  158  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03870  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  40.43 
 
 
370 aa  157  9e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39444 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  39.39 
 
 
362 aa  157  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  38.28 
 
 
323 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  38.28 
 
 
323 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3520  ATPase  40.83 
 
 
243 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4534  ABC transporter related  42.72 
 
 
365 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251009  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 
378 aa  156  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  40.93 
 
 
357 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.1 
 
 
330 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.65 
 
 
348 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.71 
 
 
345 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  46.91 
 
 
346 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  39.81 
 
 
370 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1923  ABC transporter related  41.71 
 
 
374 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142766  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  43.28 
 
 
367 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  41.9 
 
 
338 aa  155  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.12 
 
 
357 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.32 
 
 
616 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0064  ABC transporter related  40.74 
 
 
380 aa  155  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1368  ABC transporter related  40.26 
 
 
385 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.101155 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0542  ABC transporter related  42.79 
 
 
346 aa  155  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.999499  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3715  ABC type ATPase  44.79 
 
 
376 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 
356 aa  155  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  46.91 
 
 
346 aa  155  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  43.72 
 
 
601 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.95 
 
 
379 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 
357 aa  154  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  41.71 
 
 
348 aa  154  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  42.38 
 
 
358 aa  154  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  40.91 
 
 
364 aa  154  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0892  ABC transporter related  39.41 
 
 
232 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.494733  normal  0.0891232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.25 
 
 
351 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  37.66 
 
 
299 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1822  ABC transporter related  41.55 
 
 
370 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3880  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.2 
 
 
355 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314115  decreased coverage  0.00984217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>