More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3226 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3226  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3755  ABC transporter related  98.38 
 
 		 247 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.140303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  91.85 
 
 		 233 aa  434  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4506  ABC transporter related  90.13 
 
 		 233 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3669  ABC transporter related  90.13 
 
 		 233 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3858  ABC transporter related  90.13 
 
 		 233 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  87.12 
 
 		 233 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  76.72 
 
 		 233 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  76.72 
 
 		 233 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  76.72 
 
 		 233 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  76.72 
 
 		 233 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  76.72 
 
 		 233 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0591  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  76.72 
 
 		 233 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  76.72 
 
 		 233 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  76.72 
 
 		 233 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2850  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  74.56 
 
 		 233 aa  345  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6806  ABC transporter related  72.81 
 
 		 233 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000478564 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4403  ABC transporter related  68.1 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.193206  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  59.01 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0632  ABC transporter related  58.52 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225775  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05462  ABC transporter ATP-binding protein  60.18 
 
 		 245 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4331  ABC transporter related  59.53 
 
 		 247 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  0.0395621 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4221  ABC transporter related  59.53 
 
 		 247 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2578  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 261 aa  249  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2226  ABC transporter related  52.49 
 
 		 222 aa  241  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3696  ABC transporter related  49.32 
 
 		 239 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4068  ABC transporter related  52.29 
 
 		 264 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2477  ABC transporter related  50.23 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1579  ABC transporter related  50 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2789  ABC transporter related  47.77 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1481  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  49.54 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 		 366 aa  198  6e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0412  ABC transporter related  47.52 
 
 		 219 aa  188  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00532109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  46.23 
 
 		 213 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  45.33 
 
 		 602 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  40.09 
 
 		 380 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  40.09 
 
 		 380 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1484  ABC transporter related  37.55 
 
 		 391 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  40.09 
 
 		 380 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 		 604 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1441  ABC transporter related  40.39 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01620  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  38.53 
 
 		 371 aa  174  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 		 368 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.18 
 
 		 604 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 357 aa  171  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1739  ABC transporter related  38.25 
 
 		 209 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.815071  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  38.67 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1601  ABC transporter related protein  45.18 
 
 		 358 aa  170  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  44.61 
 
 		 398 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2196  ABC transporter related  41.1 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.445152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.18 
 
 		 628 aa  168  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0892  ABC transporter related  43.41 
 
 		 232 aa  168  9e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.494733  normal  0.0891232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 615 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  44.66 
 
 		 241 aa  165  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  42.41 
 
 		 357 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 		 357 aa  164  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 		 616 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  39.82 
 
 		 336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  39.09 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.11 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03870  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  41.55 
 
 		 370 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.74 
 
 		 375 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1878  molybdate ABC transporter ATPase  38.5 
 
 		 357 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.88 
 
 		 356 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1796  ABC transporter related  42.65 
 
 		 393 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165895  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  41.55 
 
 		 314 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  46.56 
 
 		 384 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0452  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.64 
 
 		 350 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  46.91 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  33.76 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0231  ABC-type transport system, ATPase component  44.29 
 
 		 235 aa  161  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  42.35 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42 
 
 		 357 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  38.05 
 
 		 289 aa  161  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.32 
 
 		 375 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.32 
 
 		 375 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  46.89 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0214  ABC transporter related  40.93 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  36.64 
 
 		 302 aa  160  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  42.86 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0256  ABC transporter related  40 
 
 		 367 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  46.91 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  43.92 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  36.82 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  40.18 
 
 		 326 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  40.18 
 
 		 326 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  44.97 
 
 		 338 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3520  ATPase  40.57 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1411  sulfate/thiosulfate transporter subunit  41.45 
 
 		 363 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  41.36 
 
 		 357 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4452  ABC transporter related  43.3 
 
 		 380 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.74 
 
 		 374 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  41.45 
 
 		 363 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.64 
 
 		 354 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  41.45 
 
 		 363 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.54 
 
 		 329 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>