More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4068 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4068  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  524  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1481  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  64.86 
 
 		 263 aa  318  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3226  ABC transporter related  52.29 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3755  ABC transporter related  52.25 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.140303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3696  ABC transporter related  48.52 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  51.6 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3669  ABC transporter related  51.14 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4221  ABC transporter related  51.8 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4331  ABC transporter related  51.8 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  0.0395621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4506  ABC transporter related  51.14 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  52.51 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3858  ABC transporter related  51.14 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0591  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  51.14 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2850  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  49.1 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  47.96 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6806  ABC transporter related  48.89 
 
 		 233 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000478564 
 
 
-
 
NC_003296  RS05462  ABC transporter ATP-binding protein  51.13 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1579  ABC transporter related  48.03 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2477  ABC transporter related  47.11 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4403  ABC transporter related  48.66 
 
 		 233 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.193206  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2226  ABC transporter related  54.12 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2789  ABC transporter related  42.7 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2578  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0412  ABC transporter related  48.54 
 
 		 219 aa  192  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00532109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0632  ABC transporter related  47.25 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225775  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  46.04 
 
 		 366 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  43.75 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  42.65 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  42.16 
 
 		 380 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 368 aa  174  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  38.29 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  44.5 
 
 		 602 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  42.16 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1601  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 358 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  47.67 
 
 		 352 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  48.73 
 
 		 348 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.27 
 
 		 367 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1484  ABC transporter related  38.83 
 
 		 391 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02320  molybdenum import ATP-binding protein ModC  47.17 
 
 		 204 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.93 
 
 		 615 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 387 aa  169  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1642  ABC-type sugar transport system, ATPase component  42.41 
 
 		 361 aa  169  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0345  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.127515  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  37.22 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  46.19 
 
 		 336 aa  169  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  50.52 
 
 		 346 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  51.06 
 
 		 355 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  48.17 
 
 		 527 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.89 
 
 		 368 aa  168  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 356 aa  168  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  47.96 
 
 		 352 aa  168  8e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5570  ABC transporter related protein  40.75 
 
 		 365 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0170  ABC transporter related  47.95 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  46.98 
 
 		 352 aa  167  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.37 
 
 		 393 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  47.12 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.32 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  41.25 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2939  ABC transporter ATP-binding protein  46.35 
 
 		 358 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.878604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  49.48 
 
 		 357 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  37.59 
 
 		 357 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  44.74 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.82 
 
 		 604 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  44.74 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.32 
 
 		 393 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2807  sulfate/thiosulfate transporter subunit  47.76 
 
 		 365 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.07 
 
 		 373 aa  165  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2586  sulfate/thiosulfate transporter subunit  47.76 
 
 		 365 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2701  sulfate/thiosulfate transporter subunit  47.76 
 
 		 365 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  49.26 
 
 		 359 aa  165  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2635  sulfate/thiosulfate transporter subunit  47.76 
 
 		 365 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.53 
 
 		 377 aa  165  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  46.6 
 
 		 355 aa  165  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  46.31 
 
 		 398 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8158  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  47.45 
 
 		 377 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2577  sulfate/thiosulfate transporter subunit  47.26 
 
 		 365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2398  ABC transporter  45.13 
 
 		 384 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0142955  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2708  sulfate/thiosulfate transporter subunit  45.87 
 
 		 365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.882672  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2677  sulfate/thiosulfate transporter subunit  47.76 
 
 		 364 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.35 
 
 		 359 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2948  sulfate/thiosulfate transporter subunit  47.26 
 
 		 364 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.579552  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1257  sulfate/thiosulfate transporter subunit  47.26 
 
 		 365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>