More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4221 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4221  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  497  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4331  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  497  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  0.0395621 
 
 
-
 
NC_003296  RS05462  ABC transporter ATP-binding protein  83.47 
 
 		 245 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0632  ABC transporter related  62.07 
 
 		 240 aa  295  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  59.83 
 
 		 244 aa  291  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6806  ABC transporter related  60.65 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000478564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2850  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  61.03 
 
 		 233 aa  271  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0591  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  60.19 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  60.65 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  60.65 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  60.65 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  60.65 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  60.65 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  60.65 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  60.65 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  57.83 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4506  ABC transporter related  57.83 
 
 		 233 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3858  ABC transporter related  57.83 
 
 		 233 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3669  ABC transporter related  57.83 
 
 		 233 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4403  ABC transporter related  60.56 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.193206  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3226  ABC transporter related  59.53 
 
 		 247 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3755  ABC transporter related  59.07 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.140303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  60.09 
 
 		 233 aa  258  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2578  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  55.46 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2226  ABC transporter related  52.73 
 
 		 222 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3696  ABC transporter related  50.91 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2789  ABC transporter related  50.22 
 
 		 253 aa  215  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4068  ABC transporter related  51.8 
 
 		 264 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2477  ABC transporter related  47.23 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1481  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  49.32 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1579  ABC transporter related  47.25 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  46.86 
 
 		 366 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0412  ABC transporter related  45.67 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00532109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 385 aa  184  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  42.13 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 		 604 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0170  ABC transporter related  52.4 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1484  ABC transporter related  42.36 
 
 		 391 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.23 
 
 		 604 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  45.66 
 
 		 338 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.71 
 
 		 628 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  43.39 
 
 		 380 aa  171  9e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  42.86 
 
 		 380 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  42.33 
 
 		 380 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4558  ABC transporter related  42.13 
 
 		 222 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 359 aa  168  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  41.96 
 
 		 602 aa  168  9e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  42.92 
 
 		 338 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01620  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  41.58 
 
 		 371 aa  167  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.43 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.06 
 
 		 616 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  39.37 
 
 		 289 aa  165  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  45.33 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  43.81 
 
 		 352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  46.63 
 
 		 355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1441  ABC transporter related  40.3 
 
 		 342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.18 
 
 		 615 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  41.89 
 
 		 336 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.74 
 
 		 379 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  46.31 
 
 		 601 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  44.33 
 
 		 336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.97 
 
 		 355 aa  161  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  45.89 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 405 aa  160  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.86 
 
 		 354 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  45.99 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0582  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  39.73 
 
 		 291 aa  159  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  35.66 
 
 		 357 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  46.45 
 
 		 384 aa  159  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  43.6 
 
 		 352 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  44.33 
 
 		 341 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  44.56 
 
 		 355 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  42.86 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 347 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2196  ABC transporter related  39.91 
 
 		 370 aa  159  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.445152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.47 
 
 		 357 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.71 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.39 
 
 		 367 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  41.43 
 
 		 350 aa  159  6e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0345  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 		 294 aa  158  8e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.127515  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 		 296 aa  158  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2257  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.5 
 
 		 352 aa  158  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  40.52 
 
 		 274 aa  158  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  42.23 
 
 		 329 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  36.82 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  42.23 
 
 		 329 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  46.41 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  44.5 
 
 		 357 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  43.84 
 
 		 367 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.38 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  43.14 
 
 		 398 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  43.75 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>