More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1556 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 385 aa  788    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  48.42 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  45.09 
 
 		 380 aa  325  7e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  44.06 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  44.39 
 
 		 380 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1822  ABC transporter related  38.07 
 
 		 370 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.61 
 
 		 352 aa  229  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  38.65 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  40.26 
 
 		 357 aa  225  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  35.65 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  34.67 
 
 		 373 aa  222  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  38.04 
 
 		 361 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.56 
 
 		 370 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  45.31 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3531  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 		 370 aa  219  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  44.9 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.94 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  46.93 
 
 		 343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  40.79 
 
 		 353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  39.79 
 
 		 364 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.88 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  40.46 
 
 		 353 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  41.18 
 
 		 355 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.63 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  40.83 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  41.49 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.25 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  36.42 
 
 		 373 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  35.61 
 
 		 369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  43.49 
 
 		 333 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0289  ABC transporter ATP-binding protein  43.01 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  34.19 
 
 		 398 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.75 
 
 		 604 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.75 
 
 		 604 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  39.48 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4786  ABC transporter related  35.12 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00107272  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  37.19 
 
 		 352 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4395  ABC transporter-related protein  34.49 
 
 		 369 aa  210  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  hitchhiker  0.0000262843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.79 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1923  ABC transporter related  37.33 
 
 		 374 aa  209  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 		 378 aa  209  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  37.46 
 
 		 349 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  38.97 
 
 		 344 aa  209  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  37.19 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 		 333 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  38.63 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.64 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  46.22 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1796  ABC transporter related  37.14 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165895  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 		 333 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  37.88 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.5 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4252  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.34 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1456  ABC transporter related  37.5 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  37.38 
 
 		 353 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.7 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  36.31 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  42.28 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 376 aa  206  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4042  ABC transporter related  38.3 
 
 		 360 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  40.07 
 
 		 331 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.93 
 
 		 357 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  43.83 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  37.19 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  36.33 
 
 		 352 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  34.83 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1794  ABC transporter ATP-binding protein  34.5 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  0.0198791 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.56 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.04 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1415  ABC transporter related  40.56 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.92 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.55 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0287  ABC transporter related  33.62 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.08 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 		 343 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0395  ABC transporter related  34.02 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.28 
 
 		 362 aa  203  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.51 
 
 		 355 aa  203  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 363 aa  203  5e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 353 aa  203  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  40.45 
 
 		 338 aa  203  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  34.02 
 
 		 367 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.07 
 
 		 331 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.54 
 
 		 362 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  35.99 
 
 		 399 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  38.57 
 
 		 363 aa  202  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  36.45 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.74 
 
 		 355 aa  202  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0686  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 		 364 aa  202  9e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  39.03 
 
 		 347 aa  202  9e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0283  ABC transporter related  33.63 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.64 
 
 		 615 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>