More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3183 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
353 aa  716    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  54.19 
 
 
357 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  53.07 
 
 
357 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.04 
 
 
357 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.82 
 
 
356 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.63 
 
 
357 aa  398  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  55.77 
 
 
360 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  54 
 
 
354 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.15 
 
 
355 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.66 
 
 
354 aa  384  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.43 
 
 
354 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  57.66 
 
 
343 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.1 
 
 
365 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.34 
 
 
362 aa  381  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.5 
 
 
371 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  56.58 
 
 
343 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  53.42 
 
 
367 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  53.48 
 
 
362 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  53.43 
 
 
355 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  52.86 
 
 
359 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.06 
 
 
363 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.5 
 
 
369 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.22 
 
 
369 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  52.94 
 
 
372 aa  363  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.24 
 
 
375 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.24 
 
 
375 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  52.94 
 
 
378 aa  362  8e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.47 
 
 
359 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  51.81 
 
 
357 aa  360  2e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.66 
 
 
374 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  52.66 
 
 
367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.8 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.43 
 
 
375 aa  356  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  54.11 
 
 
352 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.11 
 
 
352 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  54.11 
 
 
352 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2197  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.69 
 
 
359 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171508  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.29 
 
 
352 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.41 
 
 
351 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.11 
 
 
352 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.29 
 
 
352 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  54.26 
 
 
352 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.68 
 
 
365 aa  351  8.999999999999999e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  52.84 
 
 
348 aa  350  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.98 
 
 
352 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.82 
 
 
355 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.26 
 
 
352 aa  345  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.15 
 
 
369 aa  345  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.99 
 
 
374 aa  344  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0068  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  50.56 
 
 
376 aa  342  4e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  54.22 
 
 
352 aa  342  5e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.3 
 
 
338 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  51.56 
 
 
338 aa  342  5.999999999999999e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.05 
 
 
351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.42 
 
 
350 aa  335  7.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  49.44 
 
 
338 aa  335  7.999999999999999e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.48 
 
 
376 aa  334  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0649  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
373 aa  334  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.17 
 
 
351 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.86 
 
 
373 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0701  sulfate ABC transporter ATP-binding protein  51 
 
 
348 aa  333  2e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0994  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.48 
 
 
376 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1096  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.48 
 
 
376 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  51.99 
 
 
345 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0621  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51 
 
 
348 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0827201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  50.57 
 
 
349 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3295  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.2 
 
 
376 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.53786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 
376 aa  332  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.246669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1063  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.2 
 
 
376 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3095  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 
376 aa  332  8e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3015  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 
376 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0509545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.29 
 
 
346 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  51.45 
 
 
323 aa  329  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3602  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  49.31 
 
 
376 aa  328  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  49.58 
 
 
338 aa  328  7e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  50.7 
 
 
349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  50.58 
 
 
326 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.9 
 
 
339 aa  326  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.58 
 
 
329 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.58 
 
 
329 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  50.58 
 
 
326 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  50.58 
 
 
329 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.58 
 
 
329 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2577  sulfate/thiosulfate transporter subunit  48.04 
 
 
365 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2708  sulfate/thiosulfate transporter subunit  48.04 
 
 
365 aa  323  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.882672  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1239  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.04 
 
 
365 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.525663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1257  sulfate/thiosulfate transporter subunit  48.04 
 
 
365 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109195 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3652  sulfate/thiosulfate transporter subunit  48.04 
 
 
365 aa  323  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.992152  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2558  sulfate/thiosulfate transporter subunit  48.04 
 
 
365 aa  323  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.29 
 
 
329 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02322  sulfate/thiosulfate transporter subunit  48.04 
 
 
365 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2948  sulfate/thiosulfate transporter subunit  48.04 
 
 
364 aa  322  5e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.579552  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02283  hypothetical protein  48.04 
 
 
365 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>