More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1159 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
368 aa  748    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  45.94 
 
 
357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  40.56 
 
 
380 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  39.94 
 
 
380 aa  239  4e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  49.15 
 
 
604 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  39.75 
 
 
380 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.73 
 
 
604 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1484  ABC transporter related  47.01 
 
 
391 aa  229  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.31 
 
 
615 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  45.57 
 
 
602 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01620  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  45.34 
 
 
371 aa  212  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2196  ABC transporter related  44.07 
 
 
370 aa  209  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.445152  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.87 
 
 
616 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03870  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  39.67 
 
 
370 aa  207  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39444 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0256  ABC transporter related  37.7 
 
 
367 aa  203  3e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 
385 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.15 
 
 
628 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  45.83 
 
 
601 aa  196  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  33.69 
 
 
398 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0330  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
349 aa  195  9e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.29 
 
 
362 aa  195  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0982  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.84 
 
 
363 aa  193  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  34.72 
 
 
368 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  39 
 
 
363 aa  192  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  42.04 
 
 
366 aa  192  8e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1441  ABC transporter related  39 
 
 
342 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1368  ABC transporter related  33.69 
 
 
385 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.101155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1796  ABC transporter related  32.17 
 
 
393 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165895  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.44 
 
 
367 aa  189  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  36.59 
 
 
352 aa  188  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1822  ABC transporter related  35 
 
 
370 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5898  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.79 
 
 
371 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1308  ABC transporter related  36.84 
 
 
353 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1923  ABC transporter related  37.24 
 
 
374 aa  186  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142766  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  42.47 
 
 
289 aa  186  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  39.67 
 
 
359 aa  186  8e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.33 
 
 
368 aa  185  8e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  41.45 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  38.81 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  36.58 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  41.95 
 
 
375 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  44.4 
 
 
369 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.9 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.68 
 
 
413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1739  ABC transporter related  43.81 
 
 
209 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.815071  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  45 
 
 
351 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 
359 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  37.85 
 
 
381 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 
340 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0370  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.82 
 
 
371 aa  182  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.66 
 
 
376 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.685744  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.13 
 
 
362 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  40.76 
 
 
405 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  38.52 
 
 
399 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2631  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.48 
 
 
358 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  38.65 
 
 
363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.68 
 
 
368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.33 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.07 
 
 
423 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1878  molybdate ABC transporter ATPase  34.37 
 
 
357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  43.4 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.4 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.4 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0872  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.09 
 
 
385 aa  180  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0163  ABC transporter related  43.5 
 
 
383 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283601  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2547  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.92 
 
 
364 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4452  ABC transporter related  41.55 
 
 
380 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.2 
 
 
393 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2850  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  46.23 
 
 
233 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  38.87 
 
 
373 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  42.73 
 
 
353 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2235  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.22 
 
 
364 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  34.28 
 
 
365 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.83 
 
 
395 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  36.36 
 
 
356 aa  179  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  40.23 
 
 
329 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  42.73 
 
 
330 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  37.41 
 
 
363 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  40.07 
 
 
359 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.65 
 
 
370 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.42 
 
 
344 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  44.39 
 
 
356 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.17 
 
 
339 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  39.85 
 
 
329 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0682  ABC transporter-like protein  40 
 
 
337 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  36.28 
 
 
347 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.43 
 
 
346 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1797  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.16 
 
 
371 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
373 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.02 
 
 
364 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  37.41 
 
 
367 aa  177  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  37.41 
 
 
367 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  37.23 
 
 
360 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  37.23 
 
 
360 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.82 
 
 
364 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  44.04 
 
 
347 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.32 
 
 
370 aa  177  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.43 
 
 
388 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.43 
 
 
388 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.58 
 
 
373 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>