More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0163 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0163  ABC transporter related  100 
 
 
383 aa  760    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283601  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  41.54 
 
 
368 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1923  ABC transporter related  44.79 
 
 
374 aa  258  9e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142766  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3742  ABC transporter related  38.66 
 
 
367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0279  ABC transporter related  38.14 
 
 
367 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000167644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0283  ABC transporter related  39.12 
 
 
367 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0280  ABC transporter related  37.89 
 
 
367 aa  229  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000359187 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0290  ABC transporter related  39.12 
 
 
367 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  39.38 
 
 
367 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4446  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  37.69 
 
 
367 aa  227  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0287  ABC transporter related  39.12 
 
 
367 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3531  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 
370 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  37.8 
 
 
369 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  38.89 
 
 
373 aa  223  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  41.85 
 
 
368 aa  223  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0395  ABC transporter related  38.86 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4395  ABC transporter-related protein  40.36 
 
 
369 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  hitchhiker  0.0000262843 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  51.46 
 
 
375 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  34.24 
 
 
380 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  51.26 
 
 
241 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  36.86 
 
 
380 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4786  ABC transporter related  39.4 
 
 
368 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00107272  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  33.51 
 
 
380 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.15 
 
 
363 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  35.53 
 
 
354 aa  192  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.93 
 
 
340 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1393  ABC transporter related  45.32 
 
 
350 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
354 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.96 
 
 
344 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  47.33 
 
 
343 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.33 
 
 
343 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.33 
 
 
343 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  42.47 
 
 
349 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  39.94 
 
 
366 aa  186  8e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  45.12 
 
 
290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  41.29 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2197  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.43 
 
 
359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171508  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  42.38 
 
 
342 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  41.94 
 
 
351 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  44.67 
 
 
366 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 
356 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.68 
 
 
357 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.31 
 
 
355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  45.58 
 
 
302 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 
368 aa  180  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  45.41 
 
 
341 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  45.65 
 
 
349 aa  179  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003668  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  39.39 
 
 
373 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  45.8 
 
 
343 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 
351 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.52 
 
 
353 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 
351 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 
343 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 
351 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 
351 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  41.41 
 
 
309 aa  178  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  39.65 
 
 
353 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 
351 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 
351 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 
352 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  45.18 
 
 
345 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  41.18 
 
 
337 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 
351 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  46.26 
 
 
289 aa  178  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.8 
 
 
352 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  42.68 
 
 
342 aa  177  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  42.8 
 
 
352 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.06 
 
 
367 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  44.8 
 
 
352 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  41.63 
 
 
330 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  42.04 
 
 
353 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
330 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
330 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.62 
 
 
359 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  43.57 
 
 
368 aa  176  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  37.63 
 
 
356 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2777  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.26 
 
 
332 aa  176  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  37.63 
 
 
356 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.05 
 
 
357 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.45 
 
 
388 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 
330 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.45 
 
 
388 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3591  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
330 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  37.63 
 
 
356 aa  176  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.45 
 
 
388 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
330 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  40.45 
 
 
318 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 
385 aa  176  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.54 
 
 
355 aa  176  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  40.45 
 
 
318 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  42.04 
 
 
353 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.85 
 
 
352 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 
330 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0260  ABC transporter related  46.7 
 
 
632 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373262  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  44.3 
 
 
352 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.46 
 
 
376 aa  175  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.246669 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  44.86 
 
 
344 aa  175  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.04 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.22 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2803  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0416971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>