More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2534 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
354 aa  717    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  80.67 
 
 
357 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  65.83 
 
 
357 aa  482  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  66.11 
 
 
357 aa  480  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  65.27 
 
 
357 aa  474  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.03 
 
 
356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  62.96 
 
 
359 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.71 
 
 
365 aa  454  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  60.72 
 
 
360 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.89 
 
 
355 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.55 
 
 
362 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 
343 aa  434  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  61.96 
 
 
355 aa  434  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  60.45 
 
 
343 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  58.27 
 
 
367 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  59.72 
 
 
362 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 
354 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.57 
 
 
375 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.17 
 
 
354 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.24 
 
 
365 aa  425  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  60.28 
 
 
348 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.76 
 
 
375 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.42 
 
 
374 aa  421  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.76 
 
 
375 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.07 
 
 
371 aa  421  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  56.7 
 
 
372 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  57.34 
 
 
378 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  57.34 
 
 
367 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.7 
 
 
369 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.42 
 
 
369 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.68 
 
 
355 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  56.3 
 
 
352 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.68 
 
 
369 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.77 
 
 
332 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  57.68 
 
 
329 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  56.52 
 
 
326 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  57.68 
 
 
329 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.66 
 
 
353 aa  384  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  56.52 
 
 
326 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.46 
 
 
351 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  55.97 
 
 
357 aa  382  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.65 
 
 
329 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  56.73 
 
 
323 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.65 
 
 
329 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.65 
 
 
329 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 
351 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 
351 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  55.65 
 
 
329 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 
351 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.65 
 
 
329 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 
351 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 
351 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 
351 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 
351 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  54.57 
 
 
352 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  55.08 
 
 
338 aa  374  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.98 
 
 
351 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  55.65 
 
 
352 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.65 
 
 
352 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.27 
 
 
352 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.65 
 
 
330 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.65 
 
 
330 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  54.57 
 
 
352 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.69 
 
 
352 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.57 
 
 
352 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.42 
 
 
353 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.57 
 
 
352 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.69 
 
 
352 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.89 
 
 
338 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  54.57 
 
 
349 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  54.57 
 
 
338 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  53.71 
 
 
348 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  53.69 
 
 
349 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  53.11 
 
 
348 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.52 
 
 
330 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0649  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.15 
 
 
373 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.41 
 
 
348 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.65 
 
 
330 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  52.82 
 
 
345 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  53.52 
 
 
356 aa  360  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.46 
 
 
373 aa  360  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.26 
 
 
374 aa  359  5e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.12 
 
 
350 aa  358  8e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  53.3 
 
 
338 aa  357  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.97 
 
 
354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.81 
 
 
363 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.97 
 
 
359 aa  355  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  52.97 
 
 
386 aa  355  5e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  51.71 
 
 
349 aa  354  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0701  sulfate ABC transporter ATP-binding protein  52.1 
 
 
348 aa  353  2e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.7 
 
 
346 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.41 
 
 
376 aa  351  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0621  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.97 
 
 
348 aa  351  1e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0827201  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3015  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.26 
 
 
376 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0509545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1063  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.41 
 
 
376 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.56 
 
 
359 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1096  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.29 
 
 
376 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0994  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.29 
 
 
376 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3295  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.13 
 
 
376 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.53786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.26 
 
 
376 aa  350  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.246669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>