More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0107 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  100 
 
 		 375 aa  752    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  47.53 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  60.64 
 
 		 367 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0283  ABC transporter related  60.64 
 
 		 367 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0290  ABC transporter related  60.64 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0280  ABC transporter related  49.29 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000359187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0395  ABC transporter related  59.84 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  59.02 
 
 		 368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0287  ABC transporter related  60.24 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3742  ABC transporter related  59.84 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0279  ABC transporter related  59.44 
 
 		 367 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000167644 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3531  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  59.43 
 
 		 370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4446  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  59.44 
 
 		 367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  56.4 
 
 		 369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4395  ABC transporter-related protein  56.8 
 
 		 369 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  hitchhiker  0.0000262843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4786  ABC transporter related  56.4 
 
 		 368 aa  292  6e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00107272  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1393  ABC transporter related  43.6 
 
 		 350 aa  225  9e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  47.74 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1923  ABC transporter related  38.55 
 
 		 374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  45.61 
 
 		 241 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  37.33 
 
 		 380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0163  ABC transporter related  51.46 
 
 		 383 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  39.93 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  40.49 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  42.61 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.81 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.51 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.12 
 
 		 359 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  41.22 
 
 		 352 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.04 
 
 		 353 aa  186  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.61 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  43.04 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 368 aa  184  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  38.02 
 
 		 353 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.97 
 
 		 345 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 		 375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 366 aa  182  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  40 
 
 		 387 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  41.02 
 
 		 353 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.82 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  41.85 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  41.85 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  40.37 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  40.38 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  41.85 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.69 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0260  ABC transporter related  44.49 
 
 		 632 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373262  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  43.69 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.69 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1571  ABC transporter, ATP-binding protein  41.85 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  41.85 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  42.79 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.35 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  43.91 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  41.15 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  41.85 
 
 		 330 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1308  ABC transporter related  39.11 
 
 		 353 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  41.85 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0542  ABC transporter related  35.51 
 
 		 346 aa  180  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.999499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  42.22 
 
 		 339 aa  179  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 350 aa  179  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.02 
 
 		 363 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.33 
 
 		 367 aa  179  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.2 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 330 aa  179  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  35.4 
 
 		 352 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  36.26 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  40.85 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0211  ATPase  36.03 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3228  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.2 
 
 		 377 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.999114  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  36.91 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  40.85 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.23 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  43.17 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  38.04 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  42.61 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.69 
 
 		 373 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3591  ABC transporter, ATP-binding protein  40.53 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  36.63 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  40.44 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  41.15 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.49 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  44.07 
 
 		 356 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  36.76 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.76 
 
 		 362 aa  177  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1606  ABC transporter related  35.62 
 
 		 394 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256543  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.74 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.62 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  38.49 
 
 		 354 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  40.71 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>