More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4541 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
367 aa  743    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  77.46 
 
 
346 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  77.17 
 
 
346 aa  554  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  76.49 
 
 
359 aa  552  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  76.49 
 
 
386 aa  550  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  76.15 
 
 
354 aa  537  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  71.8 
 
 
345 aa  508  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1080  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.81 
 
 
363 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2257  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.77 
 
 
352 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  57.58 
 
 
356 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02515  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  54.65 
 
 
346 aa  362  7.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.33 
 
 
348 aa  361  8e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0621  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.62 
 
 
348 aa  361  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0827201  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.33 
 
 
347 aa  360  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.29 
 
 
350 aa  359  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.92 
 
 
365 aa  359  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0701  sulfate ABC transporter ATP-binding protein  54.07 
 
 
348 aa  359  5e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  52.69 
 
 
359 aa  358  7e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  53.58 
 
 
348 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.87 
 
 
348 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  53.28 
 
 
348 aa  353  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  52.94 
 
 
360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  53.01 
 
 
348 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  52.44 
 
 
345 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0559  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.9 
 
 
327 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.387345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.51 
 
 
375 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.46 
 
 
356 aa  349  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  52.02 
 
 
349 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  52.03 
 
 
378 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  60.28 
 
 
362 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.23 
 
 
375 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.23 
 
 
375 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1099  ABC transporter related  59.79 
 
 
327 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.22 
 
 
369 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  52.02 
 
 
349 aa  345  5e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.74 
 
 
376 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  59.23 
 
 
367 aa  344  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  51.52 
 
 
367 aa  344  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.95 
 
 
369 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.63 
 
 
355 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.43 
 
 
354 aa  343  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.79 
 
 
362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.4 
 
 
371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.35 
 
 
355 aa  342  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  51.38 
 
 
372 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.15 
 
 
357 aa  341  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  52.31 
 
 
349 aa  341  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
330 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.35 
 
 
352 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.16 
 
 
343 aa  339  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.18 
 
 
374 aa  339  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  54.05 
 
 
352 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.39 
 
 
369 aa  338  9e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.49 
 
 
339 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.42 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.86 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  51.72 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  51.21 
 
 
357 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.94 
 
 
352 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.94 
 
 
352 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  57.8 
 
 
329 aa  334  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.94 
 
 
352 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.66 
 
 
357 aa  333  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  54.94 
 
 
352 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  57.45 
 
 
329 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.94 
 
 
352 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.58 
 
 
373 aa  333  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.58 
 
 
329 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  54.63 
 
 
352 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  59.22 
 
 
343 aa  332  8e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  58.16 
 
 
326 aa  331  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
332 aa  331  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
351 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
351 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.45 
 
 
338 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
351 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.29 
 
 
329 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
351 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
351 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
351 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
351 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.29 
 
 
329 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  57.09 
 
 
329 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  63.27 
 
 
326 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  53.57 
 
 
338 aa  330  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.59 
 
 
353 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.34 
 
 
354 aa  329  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.84 
 
 
330 aa  329  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.29 
 
 
329 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1096  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.94 
 
 
376 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0994  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.94 
 
 
376 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1796  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.74 
 
 
376 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  50.61 
 
 
357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.79 
 
 
351 aa  328  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  51.51 
 
 
357 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 
351 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3295  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.94 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.53786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.44 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.63 
 
 
354 aa  326  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>