More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1223 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  93.06 
 
 		 372 aa  681    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  98.64 
 
 		 369 aa  731    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 369 aa  741    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  80.45 
 
 		 378 aa  584  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  79.11 
 
 		 367 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  67.93 
 
 		 362 aa  491  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  68.7 
 
 		 362 aa  491  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  66.85 
 
 		 365 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  66.49 
 
 		 374 aa  478  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  64.99 
 
 		 375 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  65.43 
 
 		 371 aa  477  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.54 
 
 		 375 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.54 
 
 		 375 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  64.5 
 
 		 367 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  61.64 
 
 		 359 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.78 
 
 		 365 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  61.8 
 
 		 354 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  60.81 
 
 		 355 aa  438  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  62.36 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  60.88 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.78 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.33 
 
 		 369 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  63.48 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  63.48 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  63.48 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  63.48 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  63.48 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.11 
 
 		 354 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.99 
 
 		 357 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  63.48 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  63.48 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.43 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  58.15 
 
 		 357 aa  425  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  62.64 
 
 		 351 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  61.02 
 
 		 352 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.03 
 
 		 352 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  62.46 
 
 		 352 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  64.95 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.75 
 
 		 352 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.46 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.29 
 
 		 353 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.62 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  61.34 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  61.62 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.62 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.7 
 
 		 354 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.26 
 
 		 355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  58.71 
 
 		 343 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  57.82 
 
 		 343 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.06 
 
 		 352 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  57.94 
 
 		 349 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.9 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  57.26 
 
 		 329 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  57.26 
 
 		 329 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  56.98 
 
 		 329 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.95 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  56.98 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.26 
 
 		 329 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.7 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.7 
 
 		 329 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  56.98 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  53.63 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  57.1 
 
 		 323 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.7 
 
 		 329 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.27 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.26 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  55.87 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  55.71 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.99 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.99 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0649  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.46 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.52 
 
 		 351 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.5 
 
 		 353 aa  371  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.73 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  55.92 
 
 		 345 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.94 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.62 
 
 		 348 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  54.62 
 
 		 348 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  55.43 
 
 		 348 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  52.53 
 
 		 338 aa  360  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.87 
 
 		 363 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55 
 
 		 350 aa  358  6e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2197  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.06 
 
 		 359 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171508  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.37 
 
 		 374 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.54 
 
 		 376 aa  352  8e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246669 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3602  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  50.54 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3015  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.27 
 
 		 376 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0509545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 376 aa  347  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3095  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.81 
 
 		 376 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0994  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 		 376 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1096  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 		 376 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3295  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 		 376 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.53786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02515  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  52.81 
 
 		 346 aa  345  5e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2708  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.46 
 
 		 365 aa  345  6e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.882672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1063  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 		 376 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  51.12 
 
 		 338 aa  345  8e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1239  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.46 
 
 		 365 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.525663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2558  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.46 
 
 		 365 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2577  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.46 
 
 		 365 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1257  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.46 
 
 		 365 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>