More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1759 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  100 
 
 
367 aa  744    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  76.78 
 
 
362 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  77.57 
 
 
362 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  74.19 
 
 
371 aa  559  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  75.54 
 
 
365 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  72.85 
 
 
375 aa  544  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  72.85 
 
 
375 aa  544  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  73.66 
 
 
374 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  70.7 
 
 
375 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  64.67 
 
 
378 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  62.4 
 
 
360 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  64.21 
 
 
359 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  64.5 
 
 
369 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  64.31 
 
 
367 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  64.5 
 
 
369 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  63.69 
 
 
372 aa  455  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.29 
 
 
356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  62.33 
 
 
355 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  61.37 
 
 
348 aa  441  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  57.1 
 
 
357 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.89 
 
 
355 aa  434  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.27 
 
 
354 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.2 
 
 
357 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  57.38 
 
 
357 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  57.88 
 
 
354 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.1 
 
 
365 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.95 
 
 
357 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.07 
 
 
354 aa  424  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.36 
 
 
369 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.67 
 
 
352 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  59.67 
 
 
352 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  60.49 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  60.49 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  60.49 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  60.49 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  60.49 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  60.49 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  60.49 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  58.74 
 
 
343 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  60.43 
 
 
351 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  59.72 
 
 
329 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  59.72 
 
 
329 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.74 
 
 
343 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.33 
 
 
332 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.44 
 
 
329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.86 
 
 
352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  60.05 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  60.33 
 
 
352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.33 
 
 
352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.05 
 
 
352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  58.61 
 
 
329 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.44 
 
 
329 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.97 
 
 
353 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.78 
 
 
352 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.78 
 
 
352 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.17 
 
 
329 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.41 
 
 
355 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  57.78 
 
 
326 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  57.18 
 
 
352 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.17 
 
 
329 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  57.73 
 
 
323 aa  398  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  57.78 
 
 
326 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.56 
 
 
330 aa  391  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  54.25 
 
 
357 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  75.52 
 
 
330 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.4 
 
 
330 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  56.16 
 
 
349 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.23 
 
 
330 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.42 
 
 
353 aa  375  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  53.97 
 
 
348 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.05 
 
 
363 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.79 
 
 
348 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  54.37 
 
 
349 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.22 
 
 
359 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2197  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.31 
 
 
359 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171508  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.77 
 
 
376 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.25 
 
 
350 aa  364  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  55.07 
 
 
348 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  54.5 
 
 
345 aa  361  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3602  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 
376 aa  360  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.72 
 
 
376 aa  360  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.246669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0649  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.45 
 
 
373 aa  358  7e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3095  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.72 
 
 
376 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3015  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.45 
 
 
376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0509545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1063  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.41 
 
 
376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0994  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.86 
 
 
376 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1096  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.86 
 
 
376 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3295  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.13 
 
 
376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.53786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.51 
 
 
351 aa  356  3.9999999999999996e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  52.6 
 
 
349 aa  353  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1411  sulfate/thiosulfate transporter subunit  60.98 
 
 
363 aa  349  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  60.98 
 
 
363 aa  349  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.96 
 
 
351 aa  348  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.87 
 
 
359 aa  348  8e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  49.87 
 
 
386 aa  348  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.41 
 
 
354 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  60.63 
 
 
363 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.78 
 
 
338 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0068  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  50.81 
 
 
376 aa  346  5e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  49.59 
 
 
338 aa  345  7e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>