More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3557 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  100 
 
 		 349 aa  698    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  86.82 
 
 		 349 aa  617  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  78.96 
 
 		 349 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  76.95 
 
 		 348 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  76.08 
 
 		 348 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  75.5 
 
 		 348 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  75.43 
 
 		 345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.93 
 
 		 350 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  57.1 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  58.92 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.92 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  54.44 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.43 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.06 
 
 		 356 aa  374  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.71 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.21 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.87 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  55.71 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.55 
 
 		 352 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  57.31 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  55.68 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  57.31 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  57.31 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.83 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.41 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  57.31 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  57.31 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  54.78 
 
 		 367 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  57.31 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  57.31 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.71 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  57.55 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  57.59 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  57.55 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.43 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.55 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  55.14 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  53.91 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.41 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.32 
 
 		 371 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  53.04 
 
 		 362 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  55.75 
 
 		 343 aa  362  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.94 
 
 		 365 aa  361  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.08 
 
 		 375 aa  361  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.08 
 
 		 375 aa  361  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.41 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.97 
 
 		 374 aa  359  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.28 
 
 		 369 aa  355  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  53.28 
 
 		 329 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  52.84 
 
 		 329 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.62 
 
 		 359 aa  355  8.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  52.27 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.62 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.16 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.16 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.71 
 
 		 354 aa  354  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  52.6 
 
 		 367 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.56 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  54.7 
 
 		 348 aa  351  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 		 354 aa  350  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.57 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52 
 
 		 354 aa  350  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.04 
 
 		 354 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.04 
 
 		 345 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2257  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54 
 
 		 352 aa  349  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.59 
 
 		 330 aa  349  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.85 
 
 		 329 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.16 
 
 		 330 aa  346  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.57 
 
 		 329 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.85 
 
 		 329 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.57 
 
 		 329 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  54.08 
 
 		 352 aa  346  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  53.3 
 
 		 323 aa  345  6e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  56.78 
 
 		 356 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  52.16 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  52.3 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.43 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.22 
 
 		 351 aa  343  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.31 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1080  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.6 
 
 		 363 aa  339  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 357 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.72 
 
 		 346 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  49.71 
 
 		 357 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.6 
 
 		 339 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.72 
 
 		 346 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.42 
 
 		 374 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.57 
 
 		 351 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  51.41 
 
 		 357 aa  330  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.16 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.42 
 
 		 363 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3312  hypothetical protein  55.4 
 
 		 325 aa  320  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.382485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.71 
 
 		 353 aa  320  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  51.55 
 
 		 371 aa  318  7e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  61.89 
 
 		 338 aa  317  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.3 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0701  sulfate ABC transporter ATP-binding protein  50.87 
 
 		 348 aa  316  3e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.55 
 
 		 371 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  61.07 
 
 		 338 aa  316  4e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  50 
 
 		 338 aa  316  5e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>