More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1239 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02322  sulfate/thiosulfate transporter subunit  99.73 
 
 
365 aa  742    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1239  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
365 aa  744    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.525663  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2948  sulfate/thiosulfate transporter subunit  92.05 
 
 
364 aa  689    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.579552  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02283  hypothetical protein  99.73 
 
 
365 aa  742    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2586  sulfate/thiosulfate transporter subunit  94.25 
 
 
365 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2807  sulfate/thiosulfate transporter subunit  94.25 
 
 
365 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2708  sulfate/thiosulfate transporter subunit  99.73 
 
 
365 aa  742    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.882672  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2677  sulfate/thiosulfate transporter subunit  93.42 
 
 
364 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2635  sulfate/thiosulfate transporter subunit  94.25 
 
 
365 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3652  sulfate/thiosulfate transporter subunit  99.73 
 
 
365 aa  741    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.992152  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2794  sulfate/thiosulfate transporter subunit  98.9 
 
 
365 aa  733    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2577  sulfate/thiosulfate transporter subunit  99.73 
 
 
365 aa  741    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2701  sulfate/thiosulfate transporter subunit  94.25 
 
 
365 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1257  sulfate/thiosulfate transporter subunit  100 
 
 
365 aa  744    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109195 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2558  sulfate/thiosulfate transporter subunit  100 
 
 
365 aa  744    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  77.38 
 
 
363 aa  574  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  77.66 
 
 
363 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1411  sulfate/thiosulfate transporter subunit  77.66 
 
 
363 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3454  sulfate/thiosulfate transporter subunit  75.68 
 
 
362 aa  564  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.1858 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0079  sulfate/thiosulfate transporter subunit  68.42 
 
 
377 aa  510  1e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.58607  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3602  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 
376 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.6 
 
 
376 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.7 
 
 
376 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.246669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.34 
 
 
373 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3015  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.35 
 
 
376 aa  364  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0509545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3095  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.35 
 
 
376 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0649  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.1 
 
 
373 aa  363  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0994  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.66 
 
 
376 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1096  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.66 
 
 
376 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3295  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.96 
 
 
376 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.53786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1063  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.96 
 
 
376 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0068  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 
376 aa  359  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  57.77 
 
 
323 aa  356  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.28 
 
 
365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.39 
 
 
375 aa  355  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  57.78 
 
 
359 aa  354  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.39 
 
 
375 aa  355  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  59.55 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.12 
 
 
374 aa  352  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.25 
 
 
356 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.4 
 
 
371 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  67.33 
 
 
352 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.66 
 
 
351 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.66 
 
 
351 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.66 
 
 
351 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.1 
 
 
369 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.66 
 
 
351 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.66 
 
 
351 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.66 
 
 
351 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.66 
 
 
351 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  59.24 
 
 
329 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.07 
 
 
355 aa  349  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  56.67 
 
 
357 aa  348  6e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.19 
 
 
365 aa  348  6e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.45 
 
 
330 aa  348  6e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  60.41 
 
 
355 aa  348  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.67 
 
 
357 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.83 
 
 
375 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
357 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.09 
 
 
355 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.3 
 
 
351 aa  346  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  55.8 
 
 
362 aa  346  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.51 
 
 
352 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  58.51 
 
 
352 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.59 
 
 
332 aa  346  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.51 
 
 
352 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.16 
 
 
352 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  61.51 
 
 
348 aa  345  5e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  57.96 
 
 
326 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.63 
 
 
369 aa  345  6e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  61.76 
 
 
343 aa  345  7e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.46 
 
 
369 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  58.16 
 
 
352 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.8 
 
 
352 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  57.64 
 
 
326 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.53 
 
 
330 aa  342  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  54.71 
 
 
329 aa  342  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  56.55 
 
 
378 aa  342  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.51 
 
 
354 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  56.55 
 
 
367 aa  341  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  56.19 
 
 
372 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.8 
 
 
353 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.45 
 
 
352 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  59.17 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  56.1 
 
 
352 aa  339  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.26 
 
 
330 aa  338  9e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  67.9 
 
 
329 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  67.9 
 
 
329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.03 
 
 
362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  67.9 
 
 
329 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.26 
 
 
330 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.14 
 
 
352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  57.93 
 
 
343 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  67.9 
 
 
329 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  62.89 
 
 
360 aa  333  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  55.94 
 
 
354 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  60.07 
 
 
349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.14 
 
 
354 aa  326  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.69 
 
 
367 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.75 
 
 
374 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>