More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0584 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  99.14 
 
 
347 aa  686    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
348 aa  694    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0559  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  96.94 
 
 
327 aa  634    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.387345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1099  ABC transporter related  81.6 
 
 
327 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.14 
 
 
376 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1796  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.29 
 
 
376 aa  374  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356789  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.05 
 
 
345 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.33 
 
 
359 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  57.73 
 
 
386 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.33 
 
 
367 aa  361  8e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.33 
 
 
346 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.33 
 
 
346 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.41 
 
 
354 aa  358  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2257  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.2 
 
 
352 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02515  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  55.1 
 
 
346 aa  344  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1080  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.03 
 
 
363 aa  341  9e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  60.14 
 
 
356 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0621  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 
348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0827201  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  51.34 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0701  sulfate ABC transporter ATP-binding protein  55.25 
 
 
348 aa  326  5e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.79 
 
 
339 aa  325  6e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.35 
 
 
365 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.99 
 
 
375 aa  324  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.99 
 
 
375 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  51.05 
 
 
345 aa  322  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.23 
 
 
356 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  54.61 
 
 
363 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.75 
 
 
354 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  50.58 
 
 
359 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1411  sulfate/thiosulfate transporter subunit  54.61 
 
 
363 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.17 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.42 
 
 
375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  61.18 
 
 
362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  54.61 
 
 
363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  56.16 
 
 
360 aa  320  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  63.6 
 
 
357 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.57 
 
 
374 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.02 
 
 
362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  62.4 
 
 
343 aa  319  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.56 
 
 
357 aa  319  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.98 
 
 
357 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  50.58 
 
 
355 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.59 
 
 
374 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  63.18 
 
 
357 aa  316  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  50 
 
 
348 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  49.7 
 
 
348 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  50 
 
 
349 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3454  sulfate/thiosulfate transporter subunit  53.57 
 
 
362 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.1858 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1797  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.6 
 
 
371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.11 
 
 
348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.57 
 
 
371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  52.94 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  61.09 
 
 
352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1239  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.19 
 
 
365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.525663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2577  sulfate/thiosulfate transporter subunit  53.19 
 
 
365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1257  sulfate/thiosulfate transporter subunit  53.19 
 
 
365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109195 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2558  sulfate/thiosulfate transporter subunit  53.19 
 
 
365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3652  sulfate/thiosulfate transporter subunit  53.19 
 
 
365 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.992152  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0079  sulfate/thiosulfate transporter subunit  51.94 
 
 
377 aa  312  4.999999999999999e-84  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.58607  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  58.69 
 
 
354 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02322  sulfate/thiosulfate transporter subunit  53.19 
 
 
365 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02283  hypothetical protein  53.19 
 
 
365 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2948  sulfate/thiosulfate transporter subunit  53.05 
 
 
364 aa  311  9e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.579552  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  50.15 
 
 
348 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2708  sulfate/thiosulfate transporter subunit  52.84 
 
 
365 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.882672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  60.67 
 
 
329 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.24 
 
 
369 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.55 
 
 
371 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  49.13 
 
 
371 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.77 
 
 
354 aa  309  5e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.12 
 
 
351 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  62.76 
 
 
355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  55.94 
 
 
326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2794  sulfate/thiosulfate transporter subunit  52.84 
 
 
365 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2701  sulfate/thiosulfate transporter subunit  52.48 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2586  sulfate/thiosulfate transporter subunit  52.48 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2807  sulfate/thiosulfate transporter subunit  52.48 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2635  sulfate/thiosulfate transporter subunit  52.48 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  60.25 
 
 
329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  60.8 
 
 
343 aa  306  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 
351 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2677  sulfate/thiosulfate transporter subunit  52.48 
 
 
364 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  59.68 
 
 
367 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.25 
 
 
338 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.85 
 
 
350 aa  305  7e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  52.4 
 
 
352 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.05 
 
 
352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  59 
 
 
326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  58.16 
 
 
329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  49.7 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  48.36 
 
 
351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  48.66 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  61.34 
 
 
332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.7 
 
 
373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>