More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3403 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  100 
 
 		 356 aa  697    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  58.47 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.04 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.62 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  59.04 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.58 
 
 		 367 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  58.56 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.5 
 
 		 354 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.37 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.62 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.15 
 
 		 374 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.06 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0701  sulfate ABC transporter ATP-binding protein  57.75 
 
 		 348 aa  362  7.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.19 
 
 		 357 aa  362  8e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0621  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.63 
 
 		 348 aa  361  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0827201  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.75 
 
 		 346 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.52 
 
 		 354 aa  360  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.62 
 
 		 346 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  55.93 
 
 		 355 aa  358  8e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  52.66 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  57.14 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 		 357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  57.18 
 
 		 348 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  57.75 
 
 		 345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.28 
 
 		 365 aa  355  8.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  56.5 
 
 		 343 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  55.93 
 
 		 348 aa  354  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.56 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  57.18 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.99 
 
 		 374 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 		 343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.14 
 
 		 348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.51 
 
 		 375 aa  352  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.99 
 
 		 351 aa  351  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02515  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  55.74 
 
 		 346 aa  349  4e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.56 
 
 		 330 aa  349  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  55.37 
 
 		 349 aa  348  6e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.7 
 
 		 330 aa  348  8e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 		 354 aa  348  9e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1080  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.96 
 
 		 363 aa  347  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.37 
 
 		 375 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.91 
 
 		 350 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.37 
 
 		 375 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.87 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  53.68 
 
 		 362 aa  346  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.82 
 
 		 354 aa  346  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.05 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.91 
 
 		 371 aa  346  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.42 
 
 		 330 aa  345  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.84 
 
 		 332 aa  345  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  56.78 
 
 		 349 aa  345  8.999999999999999e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  52.72 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.81 
 
 		 355 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.8 
 
 		 376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2257  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.4 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  52.42 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  52.71 
 
 		 329 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.88 
 
 		 329 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.88 
 
 		 329 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.57 
 
 		 329 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.57 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.57 
 
 		 352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  54.88 
 
 		 326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  54.57 
 
 		 352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.87 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  54.88 
 
 		 326 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  52.3 
 
 		 329 aa  335  7e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  53.89 
 
 		 367 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0068  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.7 
 
 		 376 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.14 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.22 
 
 		 352 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.14 
 
 		 347 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.57 
 
 		 352 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.4 
 
 		 353 aa  332  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  52.65 
 
 		 352 aa  332  5e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.57 
 
 		 352 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  52.91 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  52.01 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.99 
 
 		 352 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  51.12 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 351 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 351 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 351 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 351 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 351 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.83 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 351 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 351 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.67 
 
 		 369 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  53.72 
 
 		 352 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.72 
 
 		 352 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.22 
 
 		 373 aa  328  7e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1796  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.8 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356789  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  53.72 
 
 		 352 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  51.11 
 
 		 372 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.73 
 
 		 339 aa  326  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3015  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.45 
 
 		 376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0509545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3095  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.14 
 
 		 376 aa  325  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.14 
 
 		 376 aa  325  7e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246669 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.35 
 
 		 351 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>