More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1080 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1080  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
363 aa  719    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2257  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  70.29 
 
 
352 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.6 
 
 
359 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  59.6 
 
 
386 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.47 
 
 
367 aa  401  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.79 
 
 
354 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.15 
 
 
345 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.09 
 
 
346 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.39 
 
 
346 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  54.7 
 
 
349 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  54.68 
 
 
345 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  52.99 
 
 
348 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  54.96 
 
 
356 aa  347  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  56.75 
 
 
348 aa  346  4e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.72 
 
 
376 aa  346  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.28 
 
 
348 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  55.27 
 
 
349 aa  343  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  52.99 
 
 
348 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.03 
 
 
348 aa  341  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.03 
 
 
347 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02515  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  56.18 
 
 
346 aa  340  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0621  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.11 
 
 
348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0827201  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  56.6 
 
 
349 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.02 
 
 
355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0701  sulfate ABC transporter ATP-binding protein  52.82 
 
 
348 aa  338  9e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  51.65 
 
 
359 aa  335  5e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1099  ABC transporter related  56.36 
 
 
327 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.79 
 
 
350 aa  335  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1796  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.21 
 
 
376 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356789  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.25 
 
 
357 aa  332  5e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.3 
 
 
356 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.41 
 
 
339 aa  330  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  54.06 
 
 
360 aa  328  6e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0559  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.03 
 
 
327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.387345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  52.63 
 
 
362 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.68 
 
 
365 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.55 
 
 
338 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.27 
 
 
375 aa  321  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.37 
 
 
362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  56.6 
 
 
357 aa  320  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.59 
 
 
375 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.56 
 
 
369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.59 
 
 
375 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.5 
 
 
354 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.27 
 
 
369 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  50.56 
 
 
343 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  53.35 
 
 
343 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.55 
 
 
374 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.47 
 
 
351 aa  316  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.38 
 
 
354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  51.94 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.18 
 
 
371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  50.14 
 
 
367 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  51.07 
 
 
354 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1096  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.79 
 
 
376 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0994  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.79 
 
 
376 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  49.57 
 
 
378 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3295  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.79 
 
 
376 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.53786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.42 
 
 
374 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.05 
 
 
355 aa  309  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  51.04 
 
 
355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  49.42 
 
 
352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  49.86 
 
 
367 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  51.8 
 
 
338 aa  306  4.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 
357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1063  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.47 
 
 
376 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.41 
 
 
357 aa  305  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  46.72 
 
 
357 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1411  sulfate/thiosulfate transporter subunit  49.85 
 
 
363 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  49.85 
 
 
363 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0649  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.5 
 
 
373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  53.69 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0068  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  51.42 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  49.85 
 
 
363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3454  sulfate/thiosulfate transporter subunit  48.99 
 
 
362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.1858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.26 
 
 
376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  53.72 
 
 
371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.72 
 
 
371 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1797  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.21 
 
 
371 aa  302  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3095  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.84 
 
 
376 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.47 
 
 
369 aa  301  9e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3015  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.84 
 
 
376 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0509545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.65 
 
 
351 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.53 
 
 
376 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.246669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.7 
 
 
329 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  48.78 
 
 
326 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.8 
 
 
373 aa  300  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.85 
 
 
330 aa  299  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.7 
 
 
329 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  57.14 
 
 
338 aa  299  6e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.03 
 
 
332 aa  298  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.85 
 
 
330 aa  298  7e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  48.48 
 
 
329 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.48 
 
 
365 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.7 
 
 
329 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.67 
 
 
352 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  48.78 
 
 
326 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.39 
 
 
329 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3602  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 
376 aa  296  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  53.33 
 
 
352 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>