More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0781 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  100 
 
 
368 aa  751    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0163  ABC transporter related  41.54 
 
 
383 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283601  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1923  ABC transporter related  41.87 
 
 
374 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142766  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  38.69 
 
 
373 aa  249  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  41.08 
 
 
367 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0287  ABC transporter related  41.08 
 
 
367 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0283  ABC transporter related  40.79 
 
 
367 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0290  ABC transporter related  40.79 
 
 
367 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0280  ABC transporter related  40.51 
 
 
367 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000359187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0395  ABC transporter related  40.79 
 
 
367 aa  237  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3742  ABC transporter related  40.79 
 
 
367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  37.57 
 
 
368 aa  235  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0279  ABC transporter related  40.23 
 
 
367 aa  235  9e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000167644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4446  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 
367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3531  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
370 aa  233  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4395  ABC transporter-related protein  38.11 
 
 
369 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  hitchhiker  0.0000262843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4786  ABC transporter related  36.76 
 
 
368 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00107272  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  47.74 
 
 
375 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  35.87 
 
 
369 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  47.5 
 
 
241 aa  212  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1393  ABC transporter related  39.17 
 
 
350 aa  206  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  34.52 
 
 
380 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2120  spermidine/putrescine import ATP-binding protein  37.28 
 
 
376 aa  204  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  37.64 
 
 
357 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  34.15 
 
 
380 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  37.64 
 
 
357 aa  196  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 
357 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 
353 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.78 
 
 
356 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  42.8 
 
 
527 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  33.9 
 
 
380 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
354 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  44.03 
 
 
347 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 
385 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  38.56 
 
 
348 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0666  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.97 
 
 
367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0172946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  39.87 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  39.87 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1266  ABC transporter related  42.74 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.358849  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3271  ABC transporter related  39.68 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.800565  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  39.87 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.58 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
351 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
351 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
351 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
351 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
351 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
351 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
353 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
353 aa  182  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.42 
 
 
366 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
351 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.42 
 
 
354 aa  182  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  43.29 
 
 
367 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.29 
 
 
367 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  36.05 
 
 
347 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  35.47 
 
 
362 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
351 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  42.55 
 
 
352 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  36.36 
 
 
352 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  35.34 
 
 
360 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  36.09 
 
 
354 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003668  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  40.82 
 
 
373 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.74 
 
 
352 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  42.24 
 
 
352 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  43.42 
 
 
328 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0810  ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 
370 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  36.74 
 
 
352 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2238  ABC transporter related protein  38.1 
 
 
384 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3459  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.29 
 
 
378 aa  181  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36 
 
 
366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0260  ABC transporter related  43.53 
 
 
632 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.58 
 
 
354 aa  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  39.67 
 
 
345 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.47 
 
 
357 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1796  ABC transporter related  40.15 
 
 
393 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165895  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2153  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.42 
 
 
367 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200708  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 
343 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.77 
 
 
388 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  43.42 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  41.63 
 
 
350 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.62 
 
 
375 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  41.63 
 
 
350 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  41.63 
 
 
350 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  32.49 
 
 
367 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  35.19 
 
 
359 aa  179  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.26 
 
 
348 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2941  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 
388 aa  179  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.61 
 
 
367 aa  179  7e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  44 
 
 
366 aa  179  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.95 
 
 
361 aa  179  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.99 
 
 
343 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.01 
 
 
365 aa  179  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  45.65 
 
 
348 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.41 
 
 
364 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1050  ABC transporter related  35.91 
 
 
356 aa  179  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125219  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
393 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  42.53 
 
 
333 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  45.65 
 
 
348 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>