More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9029 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  100 
 
 		 343 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  71.01 
 
 		 347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  66.28 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  64.66 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  61.52 
 
 		 352 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  63.11 
 
 		 349 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  61.56 
 
 		 402 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  61.05 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  52.77 
 
 		 384 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  56.73 
 
 		 350 aa  312  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  48.79 
 
 		 385 aa  276  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  47.43 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  43.79 
 
 		 369 aa  238  8e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  44.16 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  48.97 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  43.85 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  43.85 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  43.85 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  47.8 
 
 		 371 aa  212  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  49.31 
 
 		 341 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1561  ABC transporter related  40.6 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  42.08 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  48.18 
 
 		 342 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  52.8 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  38.46 
 
 		 357 aa  209  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  43.47 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 		 356 aa  205  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  45.33 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  56.02 
 
 		 247 aa  204  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  49.78 
 
 		 527 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.37 
 
 		 357 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4444  ABC transporter related  47.66 
 
 		 359 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  49.18 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  35.33 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1657  ABC transporter related  38.46 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  44.49 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  37.57 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  37.19 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  35.56 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  44.19 
 
 		 391 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1206  ABC transporter related  38.17 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  50 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.42 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1685  ABC transporter related  38.17 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  50 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  50 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.81 
 
 		 390 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4846  ABC transporter, ATPase subunit  40.8 
 
 		 359 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  decreased coverage  0.000133931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4280  ABC transporter related  37.31 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  50.47 
 
 		 353 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0682  ABC transporter-like protein  42.37 
 
 		 337 aa  199  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.42 
 
 		 386 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  44.33 
 
 		 383 aa  199  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.03 
 
 		 354 aa  198  9e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2536  ABC transporter-related protein  46.94 
 
 		 359 aa  199  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  43.58 
 
 		 348 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.44 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1233  ABC transporter related  45.48 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.642029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  46.55 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  40.83 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.83 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3861  ABC transporter related  46.2 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.99 
 
 		 387 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3454  sulfate/thiosulfate transporter subunit  40.45 
 
 		 362 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.1858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  43.59 
 
 		 347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  37.88 
 
 		 371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4507  ABC transporter related protein  41.69 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.462419  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1108  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  47.47 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.81433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  31.01 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.1 
 
 		 365 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 		 354 aa  196  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  33.84 
 
 		 355 aa  196  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.12 
 
 		 354 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3338  ABC transporter related  40.97 
 
 		 352 aa  195  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.58 
 
 		 380 aa  195  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1300  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 378 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1057  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2309  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1787  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1591  ABC transporter related  46.73 
 
 		 359 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1610  ABC transporter related  46.73 
 
 		 359 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0108  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2178  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.455758  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.65 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2122  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  38.07 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2277  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  31.12 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1075  ATPase  48.29 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243658  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.53 
 
 		 354 aa  193  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.31 
 
 		 371 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  40.94 
 
 		 352 aa  193  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.99 
 
 		 388 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  39.25 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  38.08 
 
 		 384 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>