More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2557 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  100 
 
 		 402 aa  781    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  61.93 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  61.56 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  60.4 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  59.25 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  56.53 
 
 		 354 aa  346  5e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  56.25 
 
 		 354 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  57.51 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  50.14 
 
 		 384 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  55.68 
 
 		 350 aa  296  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  50.54 
 
 		 385 aa  295  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  42.02 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  38.04 
 
 		 386 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  44.41 
 
 		 358 aa  225  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.53 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  46.99 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.53 
 
 		 386 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.37 
 
 		 390 aa  222  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.37 
 
 		 386 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.37 
 
 		 386 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.37 
 
 		 386 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.49 
 
 		 388 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.94 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3516  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  47.5 
 
 		 329 aa  215  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2277  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 		 386 aa  215  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.97 
 
 		 387 aa  215  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0108  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 		 386 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432666  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1300  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1057  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 		 386 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2309  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2178  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.455758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1787  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 		 386 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3161  ABC transporter related  47.08 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0305522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0939  ABC putrescine transporter, ATPase subunit PotG  47.53 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301968  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.32 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.56 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4663  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.7 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.18 
 
 		 384 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.18 
 
 		 384 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2122  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 		 386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.2 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  38.92 
 
 		 371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 		 384 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  48.21 
 
 		 384 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7682  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  39.69 
 
 		 379 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.3686 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 		 384 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  43.84 
 
 		 346 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  43.84 
 
 		 346 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  43.84 
 
 		 346 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.18 
 
 		 384 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2813  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  47.3 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  48.39 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.31 
 
 		 359 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.12 
 
 		 377 aa  210  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1263  putrescine transport ATP-binding protein PotG  40.79 
 
 		 381 aa  209  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1366  putative putrescine transport ATP-binding protein  35.79 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 		 377 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 		 377 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 		 377 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.64 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4507  ABC transporter related protein  41.35 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.462419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.07 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  37.74 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.16 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  48.51 
 
 		 527 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1949  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.415824  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  45.95 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  45.95 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.66 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  45.95 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0393  polyamine transport protein PotG  47.75 
 
 		 384 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.39 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.39 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.39 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03940  polyamine transport protein PotG  47.75 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  46.36 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  43.87 
 
 		 361 aa  206  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.96 
 
 		 380 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.29 
 
 		 400 aa  206  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  48.93 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  42.16 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.16 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  42.16 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.16 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.03 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.47 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000353928 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.16 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.33 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0347  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.85 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  50.43 
 
 		 367 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48750  polyamine ABC transporter ATP-binding subunit, PotG subunit  48.64 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0473431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.85 
 
 		 371 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  37.65 
 
 		 351 aa  204  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 378 aa  204  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.31 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.16 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>