More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0682 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0682  ABC transporter-like protein  100 
 
 
337 aa  661    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0930  ABC transporter related protein  64.95 
 
 
318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  47.81 
 
 
328 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.51 
 
 
366 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.79 
 
 
382 aa  242  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.55 
 
 
378 aa  241  9e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.95 
 
 
370 aa  240  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0669112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.06 
 
 
380 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688295  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0393  polyamine transport protein PotG  47.86 
 
 
384 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  51.75 
 
 
366 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03940  polyamine transport protein PotG  47.86 
 
 
384 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48750  polyamine ABC transporter ATP-binding subunit, PotG subunit  49.03 
 
 
383 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0473431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.8 
 
 
382 aa  238  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5179  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  46.9 
 
 
380 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5086  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.9 
 
 
380 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.75 
 
 
370 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.72 
 
 
390 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.75 
 
 
368 aa  237  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.89 
 
 
352 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  51.82 
 
 
381 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5239  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.9 
 
 
380 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  51.82 
 
 
384 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.46 
 
 
388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.46 
 
 
388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0823  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.23 
 
 
376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.46 
 
 
388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  43.17 
 
 
329 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  47.92 
 
 
377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.49 
 
 
383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.08 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1080  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.84 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.09 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  46.86 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.08 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.09 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  45.55 
 
 
329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  46.67 
 
 
371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.09 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  46.54 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.09 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.08 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.09 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0347  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.33 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.89864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.08 
 
 
378 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.08 
 
 
378 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.08 
 
 
378 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.67 
 
 
352 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  47.08 
 
 
378 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 
378 aa  233  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.08 
 
 
378 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.08 
 
 
378 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  48.74 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.74 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.74 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  47.58 
 
 
329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.74 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.66 
 
 
372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.36 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  45.32 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.74 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  52.26 
 
 
363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  48.74 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.74 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.74 
 
 
377 aa  233  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  48.02 
 
 
339 aa  232  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0370  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.26 
 
 
371 aa  232  6e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  44.96 
 
 
328 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.37 
 
 
329 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.32 
 
 
377 aa  232  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  43.49 
 
 
329 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  49.39 
 
 
387 aa  232  8.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  47.13 
 
 
331 aa  232  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.79 
 
 
354 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.32 
 
 
377 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48 
 
 
423 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.36 
 
 
348 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.83 
 
 
426 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  44.1 
 
 
329 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  54.63 
 
 
342 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.32 
 
 
377 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.32 
 
 
377 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.19 
 
 
331 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.21 
 
 
368 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000353928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.32 
 
 
377 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.32 
 
 
377 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.75 
 
 
345 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  48.32 
 
 
400 aa  230  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.89 
 
 
378 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.68 
 
 
373 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49 
 
 
338 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.57 
 
 
368 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.88 
 
 
378 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.33 
 
 
361 aa  229  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  47.9 
 
 
377 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  47.14 
 
 
339 aa  229  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.83 
 
 
377 aa  229  7e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  46.47 
 
 
378 aa  228  9e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.78 
 
 
371 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  47.48 
 
 
377 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  47.48 
 
 
377 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>