More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3986 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  60.27 
 
 		 385 aa  238  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  58.8 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  58.33 
 
 		 354 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  56.02 
 
 		 344 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  53.51 
 
 		 384 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  54.59 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.02 
 
 		 343 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  52.31 
 
 		 347 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  50.93 
 
 		 402 aa  185  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  56.65 
 
 		 350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  49.07 
 
 		 352 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1380  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  46.31 
 
 		 356 aa  168  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.33894  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  48.29 
 
 		 369 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  46.46 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  43.56 
 
 		 356 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1343  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.77 
 
 		 378 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 356 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  47.92 
 
 		 355 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 		 356 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  44.5 
 
 		 342 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  47.12 
 
 		 233 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  46.27 
 
 		 355 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0211  ATPase  41.55 
 
 		 352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  43.27 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  46.53 
 
 		 355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  46.53 
 
 		 371 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  46.53 
 
 		 355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  46.53 
 
 		 355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  41.55 
 
 		 352 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0823  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.44 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  42.51 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  42.86 
 
 		 363 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  45.77 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2869  ABC transporter related  43.28 
 
 		 361 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0665765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2784  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  44.86 
 
 		 359 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000880352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09571  ABC transporter ATP-binding protein  44.95 
 
 		 356 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0852854  hitchhiker  0.000225107 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 346 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 354 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3216  ABC transporter related  43.63 
 
 		 361 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  45.81 
 
 		 1057 aa  161  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  49.31 
 
 		 359 aa  161  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3669  ABC transporter related  46.63 
 
 		 233 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  45.67 
 
 		 355 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4506  ABC transporter related  46.63 
 
 		 233 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3947  ABC transporter-related protein  42.57 
 
 		 356 aa  161  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.615077 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3858  ABC transporter related  46.63 
 
 		 233 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4221  ABC transporter related  45.89 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.62 
 
 		 386 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4331  ABC transporter related  45.89 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  0.0395621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  50.26 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2941  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.83 
 
 		 388 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.62 
 
 		 386 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3755  ABC transporter related  46.89 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.140303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  42.92 
 
 		 380 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3226  ABC transporter related  46.89 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  47.6 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.62 
 
 		 386 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  46.12 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.59 
 
 		 378 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1285  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  47.52 
 
 		 362 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.85 
 
 		 381 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0826  ABC transporter related  44.81 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  46.04 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  46.88 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 		 381 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  45.19 
 
 		 336 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3520  ATPase  45.27 
 
 		 243 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2008  ABC transporter related  37.86 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.528058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  46.97 
 
 		 364 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  43.54 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  46.22 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4341  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.72 
 
 		 374 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.884893 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2939  ABC transporter ATP-binding protein  43.63 
 
 		 358 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.878604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1518  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.4 
 
 		 376 aa  158  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  48.51 
 
 		 361 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  39.9 
 
 		 385 aa  158  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  46.8 
 
 		 389 aa  158  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  48.29 
 
 		 342 aa  158  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6379  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.26 
 
 		 360 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  45.19 
 
 		 336 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  43.75 
 
 		 349 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  42.38 
 
 		 343 aa  158  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 339 aa  158  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  40.59 
 
 		 380 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  43.2 
 
 		 342 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  45.05 
 
 		 390 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 		 388 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1358  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.73 
 
 		 374 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  43.96 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  43.56 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>