More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  100 
 
 
372 aa  706    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  53.39 
 
 
367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  51.22 
 
 
347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  53.93 
 
 
346 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  48.91 
 
 
369 aa  280  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  49.47 
 
 
358 aa  265  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  51.08 
 
 
358 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  51.08 
 
 
358 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  51.08 
 
 
358 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  47.95 
 
 
347 aa  249  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  52.1 
 
 
371 aa  248  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.43 
 
 
343 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  46.86 
 
 
361 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2536  ABC transporter-related protein  50.27 
 
 
359 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4175  ABC transporter related  54.52 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  46.72 
 
 
354 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3861  ABC transporter related  51.11 
 
 
358 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  43.05 
 
 
384 aa  228  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  48.64 
 
 
350 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  45.08 
 
 
352 aa  224  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  46.99 
 
 
402 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  45.55 
 
 
349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  44.41 
 
 
354 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1233  ABC transporter related  51.49 
 
 
361 aa  212  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.642029  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4507  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
367 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.462419  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  42.42 
 
 
385 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  43.75 
 
 
344 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2304  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
335 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0243  ABC transporter  31.89 
 
 
340 aa  181  2e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  42.91 
 
 
389 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  37.28 
 
 
354 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  31.23 
 
 
347 aa  179  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 
340 aa  176  6e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  36.16 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  35.35 
 
 
356 aa  172  9e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4042  ABC transporter related  37.18 
 
 
360 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643948  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  40.08 
 
 
349 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  42.66 
 
 
357 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  36.86 
 
 
383 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1601  ABC transporter related protein  40.06 
 
 
358 aa  169  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  38.49 
 
 
365 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  32.17 
 
 
368 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1851  ABC transporter related  45.07 
 
 
219 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0521462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  32.17 
 
 
353 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.23 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.23 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.23 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.23 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.23 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  35.29 
 
 
343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.23 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 
351 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  36.07 
 
 
367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0178  ABC transporter related  40.07 
 
 
346 aa  166  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.360514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  39.93 
 
 
364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  36.47 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  35.49 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.06 
 
 
351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0326  ABC transporter related  38.98 
 
 
372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2987  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.69 
 
 
366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238574  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  35.76 
 
 
356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 
353 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  34.26 
 
 
357 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.31 
 
 
363 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.17 
 
 
375 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.79 
 
 
352 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  39.11 
 
 
408 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  32.2 
 
 
364 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.01 
 
 
367 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.17 
 
 
375 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 
354 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  35.07 
 
 
355 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3338  ABC transporter related  34.75 
 
 
352 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1908  ABC transporter ATP-binding protein  36.1 
 
 
368 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  39.04 
 
 
243 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  43.24 
 
 
365 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  36.94 
 
 
363 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2267  ABC transporter related protein  46.55 
 
 
351 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  34.93 
 
 
359 aa  160  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.75 
 
 
357 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
352 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.95 
 
 
369 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.57 
 
 
351 aa  160  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  32.31 
 
 
367 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  38.55 
 
 
370 aa  159  6e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.31 
 
 
367 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
352 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1484  ABC transporter related  33.09 
 
 
391 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
367 aa  159  7e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  43.1 
 
 
378 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1266  ABC transporter related  34.75 
 
 
365 aa  159  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.358849  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.05 
 
 
375 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  46.22 
 
 
247 aa  159  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.6 
 
 
354 aa  159  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0191  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase component  38.56 
 
 
368 aa  159  9e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  32.62 
 
 
360 aa  159  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 
374 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.43 
 
 
374 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  37.5 
 
 
352 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.79 
 
 
373 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>