More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1484 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1484  ABC transporter related  100 
 
 
391 aa  802    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.47 
 
 
604 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  50.16 
 
 
604 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.95 
 
 
615 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  45.45 
 
 
602 aa  299  6e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2196  ABC transporter related  45.54 
 
 
370 aa  298  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.445152  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0256  ABC transporter related  45.83 
 
 
367 aa  294  1e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  48.51 
 
 
601 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01620  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  43.81 
 
 
371 aa  282  8.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45 
 
 
628 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.57 
 
 
616 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0330  ABC transporter related protein  43.11 
 
 
349 aa  267  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03870  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  38.94 
 
 
370 aa  252  9.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39444 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1441  ABC transporter related  43.75 
 
 
342 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
368 aa  229  6e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  46.15 
 
 
309 aa  200  3e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  42.74 
 
 
380 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  37.63 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3696  ABC transporter related  42.65 
 
 
239 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
385 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  42.08 
 
 
380 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  44 
 
 
366 aa  193  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1481  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  39.3 
 
 
263 aa  189  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  41.7 
 
 
289 aa  187  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 
244 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  40.18 
 
 
233 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  39.73 
 
 
233 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  38.87 
 
 
368 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
233 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  37.77 
 
 
398 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
233 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0591  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
233 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
233 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
233 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
233 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4506  ABC transporter related  39.73 
 
 
233 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3669  ABC transporter related  39.73 
 
 
233 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
233 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3858  ABC transporter related  39.73 
 
 
233 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447489  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
233 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.74 
 
 
351 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.62 
 
 
373 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3755  ABC transporter related  37.55 
 
 
247 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.140303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1368  ABC transporter related  30.42 
 
 
385 aa  179  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.101155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  39.91 
 
 
342 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3226  ABC transporter related  37.55 
 
 
247 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.51 
 
 
359 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  41.63 
 
 
289 aa  179  9e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0395  ABC transporter related  35.71 
 
 
367 aa  179  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  36.08 
 
 
368 aa  179  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 
330 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  39.52 
 
 
330 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
333 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  38.1 
 
 
353 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  39.05 
 
 
318 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  39.05 
 
 
318 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 
330 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  39.33 
 
 
333 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  35.71 
 
 
367 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1923  ABC transporter related  40.79 
 
 
374 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142766  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.19 
 
 
343 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 
330 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 
330 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 
343 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6806  ABC transporter related  41.18 
 
 
233 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000478564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  41.74 
 
 
356 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 
330 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4221  ABC transporter related  42.36 
 
 
247 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4331  ABC transporter related  42.36 
 
 
247 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  0.0395621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.74 
 
 
356 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4452  ABC transporter related  39.34 
 
 
380 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2850  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  40.27 
 
 
233 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1579  ABC transporter related  38.29 
 
 
259 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6023  ABC transporter-related protein  35.14 
 
 
367 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05462  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
245 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  39.48 
 
 
299 aa  176  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3591  ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 
330 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  39.13 
 
 
349 aa  176  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  38.84 
 
 
343 aa  176  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1571  ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 
330 aa  176  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2789  ABC transporter related  37.9 
 
 
253 aa  176  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.55 
 
 
362 aa  176  9e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0283  ABC transporter related  38.11 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  37.7 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  37.83 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0163  ABC transporter related  40.97 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283601  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0632  ABC transporter related  37.89 
 
 
240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  32.69 
 
 
338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  33.87 
 
 
359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 
346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  37.83 
 
 
349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0287  ABC transporter related  37.7 
 
 
367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  36.92 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 
353 aa  173  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  37.39 
 
 
349 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 
353 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  37.39 
 
 
349 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 
349 aa  172  7.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  37.55 
 
 
355 aa  172  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>