More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2789 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2789  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2477  ABC transporter related  54.4 
 
 		 260 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3696  ABC transporter related  52.19 
 
 		 239 aa  238  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1579  ABC transporter related  50.2 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0591  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  53.15 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6806  ABC transporter related  51.13 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000478564 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4331  ABC transporter related  50.22 
 
 		 247 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  0.0395621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2850  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  49.57 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4221  ABC transporter related  50.22 
 
 		 247 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05462  ABC transporter ATP-binding protein  51.35 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2226  ABC transporter related  49.11 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2578  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 261 aa  211  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  49.33 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 		 244 aa  208  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3669  ABC transporter related  48.88 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4403  ABC transporter related  48.54 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.193206  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4506  ABC transporter related  48.88 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3858  ABC transporter related  48.88 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0632  ABC transporter related  47.96 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225775  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3226  ABC transporter related  47.77 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3755  ABC transporter related  47.79 
 
 		 247 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.140303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1481  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  48.94 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  46.67 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0170  ABC transporter related  49.21 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4068  ABC transporter related  42.7 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0412  ABC transporter related  45.7 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00532109  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  43.06 
 
 		 380 aa  185  6e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  44.39 
 
 		 380 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  43.32 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  42.04 
 
 		 366 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 		 604 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  39.91 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 385 aa  178  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 		 604 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1484  ABC transporter related  37.9 
 
 		 391 aa  175  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  41.55 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1739  ABC transporter related  39.55 
 
 		 209 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.815071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  39.91 
 
 		 289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  45.21 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 		 628 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  38.08 
 
 		 289 aa  168  7e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  44.33 
 
 		 398 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.67 
 
 		 367 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  40.72 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 368 aa  166  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.15 
 
 		 616 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  38.99 
 
 		 366 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.67 
 
 		 367 aa  165  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.08 
 
 		 615 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0826  ABC transporter related  46.11 
 
 		 357 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.83 
 
 		 346 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.72 
 
 		 353 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  41.49 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  49.48 
 
 		 352 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1796  ABC transporter related  44.83 
 
 		 393 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165895  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  39.13 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  44.22 
 
 		 336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  46.56 
 
 		 352 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2209  ABC transporter related  39.34 
 
 		 242 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0453823  normal  0.57752 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  44.22 
 
 		 336 aa  161  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 		 351 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 		 353 aa  161  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 		 353 aa  161  9e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 378 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1380  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.33894  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1441  ABC transporter related  37.56 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1531  ABC transporter related  43.01 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.952965  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  39.45 
 
 		 602 aa  159  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01620  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  37.44 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0507  ABC transporter related protein  45.64 
 
 		 353 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4558  ABC transporter related  41.82 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168786  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  45.79 
 
 		 347 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 390 aa  159  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  42.31 
 
 		 363 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  45.13 
 
 		 355 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1878  molybdate ABC transporter ATPase  43 
 
 		 357 aa  158  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 		 370 aa  158  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  46.91 
 
 		 342 aa  158  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 		 343 aa  158  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.9 
 
 		 349 aa  158  8e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 		 348 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1343  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.74 
 
 		 378 aa  158  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1368  ABC transporter related  41.46 
 
 		 385 aa  158  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.101155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  41.71 
 
 		 338 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0231  ABC-type transport system, ATPase component  40.19 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  45.08 
 
 		 340 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.79 
 
 		 370 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  42.36 
 
 		 333 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  41.59 
 
 		 356 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  43.09 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  41.45 
 
 		 356 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.06 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  44.29 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>