More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05462 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05462  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 245 aa  487  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4221  ABC transporter related  83.47 
 
 		 247 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4331  ABC transporter related  83.47 
 
 		 247 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  0.0395621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  61.02 
 
 		 244 aa  294  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0632  ABC transporter related  64.38 
 
 		 240 aa  289  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225775  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6806  ABC transporter related  60.81 
 
 		 233 aa  275  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000478564 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0591  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  60.34 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2850  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  61.19 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  61.71 
 
 		 233 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  61.71 
 
 		 233 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  61.71 
 
 		 233 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  61.71 
 
 		 233 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  61.71 
 
 		 233 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  61.71 
 
 		 233 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  61.71 
 
 		 233 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  62.1 
 
 		 233 aa  268  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3669  ABC transporter related  61.54 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4506  ABC transporter related  61.54 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3858  ABC transporter related  61.54 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  60.63 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3226  ABC transporter related  60.18 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3755  ABC transporter related  60.18 
 
 		 247 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.140303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4403  ABC transporter related  60.73 
 
 		 233 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.193206  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2578  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 		 261 aa  255  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2226  ABC transporter related  53.6 
 
 		 222 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3696  ABC transporter related  49.32 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2789  ABC transporter related  51.35 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4068  ABC transporter related  51.13 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2477  ABC transporter related  47.01 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1481  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  45.33 
 
 		 366 aa  192  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1579  ABC transporter related  45.66 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  42.99 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  37.91 
 
 		 385 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0412  ABC transporter related  43.64 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00532109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1441  ABC transporter related  42.86 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1484  ABC transporter related  40 
 
 		 391 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.63 
 
 		 604 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.2 
 
 		 628 aa  175  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.14 
 
 		 604 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.12 
 
 		 616 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 355 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 355 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 355 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 355 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.85 
 
 		 359 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 355 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  42.86 
 
 		 380 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 355 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 355 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01620  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  39.27 
 
 		 371 aa  166  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  42.27 
 
 		 602 aa  165  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4558  ABC transporter related  40.47 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168786  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  41.27 
 
 		 380 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.79 
 
 		 379 aa  164  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0170  ABC transporter related  49.76 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  40.74 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2196  ABC transporter related  41.1 
 
 		 370 aa  163  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.445152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 		 368 aa  163  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0345  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.127515  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  42.99 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  44.04 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.98 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.26 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.97 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  44.04 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  44.97 
 
 		 355 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  38.07 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  42.79 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.41 
 
 		 615 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  41.59 
 
 		 338 aa  158  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  44.97 
 
 		 355 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  42.78 
 
 		 352 aa  158  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0507  ABC transporter related protein  46.91 
 
 		 353 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.74 
 
 		 353 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  45.5 
 
 		 355 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  42.25 
 
 		 348 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  43.16 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  46.56 
 
 		 387 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  44.97 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  43.16 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  43.19 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  44.97 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  43.35 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1136  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.89 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  40.65 
 
 		 329 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  44.97 
 
 		 355 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.54 
 
 		 357 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  45.5 
 
 		 378 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1739  ABC transporter related  37.79 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.815071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  38.64 
 
 		 289 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.08 
 
 		 377 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 405 aa  155  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  44.44 
 
 		 355 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0260  ABC transporter related  45.36 
 
 		 632 aa  154  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373262  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 		 353 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  43.92 
 
 		 355 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  43.3 
 
 		 601 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 		 357 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>