More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3696 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3696  ABC transporter related  100 
 
 
239 aa  488  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2477  ABC transporter related  48.39 
 
 
260 aa  238  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2789  ABC transporter related  52.19 
 
 
253 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  47.95 
 
 
244 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0632  ABC transporter related  49.55 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225775  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2850  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  48.89 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6806  ABC transporter related  50.23 
 
 
233 aa  231  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000478564 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0591  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
233 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4331  ABC transporter related  50.91 
 
 
247 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  0.0395621 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4221  ABC transporter related  50.91 
 
 
247 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3226  ABC transporter related  49.32 
 
 
247 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4506  ABC transporter related  49.55 
 
 
233 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3669  ABC transporter related  49.55 
 
 
233 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3858  ABC transporter related  49.55 
 
 
233 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447489  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3755  ABC transporter related  49.32 
 
 
247 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.140303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4403  ABC transporter related  47.56 
 
 
233 aa  224  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.193206  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  49.1 
 
 
233 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_003296  RS05462  ABC transporter ATP-binding protein  49.32 
 
 
245 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  48.2 
 
 
233 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2578  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
261 aa  216  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4068  ABC transporter related  48.52 
 
 
264 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1579  ABC transporter related  51.34 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1481  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  45.92 
 
 
263 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2226  ABC transporter related  44.8 
 
 
222 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248839  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 
366 aa  197  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  45.41 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1484  ABC transporter related  42.65 
 
 
391 aa  194  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0412  ABC transporter related  44.65 
 
 
219 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00532109  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0170  ABC transporter related  49.32 
 
 
258 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  43.91 
 
 
380 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  43.48 
 
 
380 aa  188  7e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
385 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  40.64 
 
 
309 aa  185  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  43.06 
 
 
213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1739  ABC transporter related  44.08 
 
 
209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.815071  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.71 
 
 
604 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.23 
 
 
604 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1554  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  44.06 
 
 
357 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1441  ABC transporter related  39.23 
 
 
342 aa  177  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.61 
 
 
615 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  43.06 
 
 
602 aa  175  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  40.64 
 
 
289 aa  175  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  48.21 
 
 
357 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  46.04 
 
 
398 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.36 
 
 
628 aa  172  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  46.73 
 
 
601 aa  171  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 
368 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3520  ATPase  41.12 
 
 
243 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03870  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  40.99 
 
 
370 aa  169  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39444 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0256  ABC transporter related  39.37 
 
 
367 aa  169  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1796  ABC transporter related  43.2 
 
 
393 aa  168  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165895  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3143  ABC transporter related  45.26 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1387  sulphate transport system permease protein 1  45.96 
 
 
240 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.748727 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  40.18 
 
 
302 aa  165  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1074  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  45.69 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278365  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  44.1 
 
 
356 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.24 
 
 
616 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0507  ABC transporter related protein  46.49 
 
 
353 aa  165  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  43.14 
 
 
241 aa  164  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  37.9 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1601  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
358 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  42.56 
 
 
360 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1368  ABC transporter related  42.58 
 
 
385 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.101155 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  41.51 
 
 
356 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0231  ABC-type transport system, ATPase component  46.04 
 
 
235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0582  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  39.57 
 
 
291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  41.18 
 
 
314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  39.27 
 
 
299 aa  161  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1642  ABC-type sugar transport system, ATPase component  39.17 
 
 
361 aa  161  7e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174606  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  44.89 
 
 
290 aa  161  9e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 
349 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  44.21 
 
 
349 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  44.21 
 
 
349 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4558  ABC transporter related  41.41 
 
 
222 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  43.35 
 
 
385 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  44.74 
 
 
336 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  44.21 
 
 
336 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.84 
 
 
343 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2196  ABC transporter related  39.64 
 
 
370 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.445152  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0345  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 
294 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.127515  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1878  molybdate ABC transporter ATPase  39.73 
 
 
357 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 
296 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.52 
 
 
352 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 
355 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  42.52 
 
 
348 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 
355 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 
355 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 
355 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  43.9 
 
 
345 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  46.31 
 
 
384 aa  158  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
367 aa  158  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 
355 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 
355 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>