More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3143 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3143  ABC transporter related  100 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  47.28 
 
 		 314 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1442  ABC transporter related  45.31 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  44.98 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0417  ABC transporter related  42.03 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  47.32 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0360  molybdenum transport ATP-binding protein  38.32 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0582  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  41.57 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  40.73 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2243  ABC transporter related  49.23 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2281  RNA pseudouridine synthase  39.27 
 
 		 285 aa  193  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  47.32 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0345  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  48.53 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.127515  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  46.83 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  48.53 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1716  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.604131  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.76 
 
 		 347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.76 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  49.5 
 
 		 353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0559  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.3 
 
 		 327 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.387345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.2 
 
 		 338 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  46.51 
 
 		 355 aa  182  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.19 
 
 		 344 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1829  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.96 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.86 
 
 		 367 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.41 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 		 376 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  44.23 
 
 		 354 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  49.48 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  49.27 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  46.31 
 
 		 347 aa  178  9e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  45.19 
 
 		 341 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1796  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.24 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.71 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  44.71 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.71 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  46.63 
 
 		 338 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.19 
 
 		 402 aa  176  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.95 
 
 		 357 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  42.23 
 
 		 398 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  47.85 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  40.58 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  45.71 
 
 		 354 aa  176  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  46.31 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.71 
 
 		 359 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  42.69 
 
 		 349 aa  175  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.71 
 
 		 341 aa  175  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 343 aa  175  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0315  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  41.46 
 
 		 284 aa  175  7e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.599525  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  44.95 
 
 		 351 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.04 
 
 		 378 aa  175  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.04 
 
 		 378 aa  175  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.04 
 
 		 378 aa  175  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.04 
 
 		 378 aa  175  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.04 
 
 		 378 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  41.04 
 
 		 378 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.04 
 
 		 378 aa  175  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0079  sulfate/thiosulfate transporter subunit  45.17 
 
 		 377 aa  175  9e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.58607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.04 
 
 		 378 aa  175  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.04 
 
 		 378 aa  175  9e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  44.93 
 
 		 353 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.93 
 
 		 351 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.24 
 
 		 354 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.93 
 
 		 336 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  44.23 
 
 		 351 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  43.75 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  43.35 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.75 
 
 		 349 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  44.44 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  40.47 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  44.7 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.27 
 
 		 352 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  45.87 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.19 
 
 		 349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  45.79 
 
 		 338 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  46.08 
 
 		 356 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0163  ABC transporter related  45.45 
 
 		 383 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  43.96 
 
 		 375 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3095  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.37 
 
 		 376 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1099  ABC transporter related  40.6 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  46.15 
 
 		 349 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  41.55 
 
 		 356 aa  172  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  46.15 
 
 		 349 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0279  ABC transporter related  43.69 
 
 		 367 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000167644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3015  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.37 
 
 		 376 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0509545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3742  ABC transporter related  43.69 
 
 		 367 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  46.15 
 
 		 349 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.24 
 
 		 378 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3531  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 370 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.24 
 
 		 378 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.96 
 
 		 372 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.75 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.24 
 
 		 378 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  43.2 
 
 		 319 aa  172  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.24 
 
 		 378 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.24 
 
 		 378 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>