More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1442 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1442  ABC transporter related  100 
 
 		 315 aa  613  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  66.78 
 
 		 314 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  40.15 
 
 		 290 aa  230  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  43.68 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3143  ABC transporter related  46.48 
 
 		 275 aa  218  8.999999999999998e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0345  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.127515  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2243  ABC transporter related  47.58 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  38.62 
 
 		 289 aa  209  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  38.19 
 
 		 289 aa  209  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  39.31 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0417  ABC transporter related  40.57 
 
 		 301 aa  207  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0360  molybdenum transport ATP-binding protein  40.73 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  35.64 
 
 		 309 aa  203  4e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0582  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  40.61 
 
 		 291 aa  202  6e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2281  RNA pseudouridine synthase  39.71 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  49.75 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1716  ABC transporter related protein  40.79 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.604131  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.6 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50700  ABC transporter ATP binding component  47.35 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.933141  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  44.34 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.58 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  49.29 
 
 		 356 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0559  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.6 
 
 		 327 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.387345 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.29 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0315  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  37.26 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.599525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.68 
 
 		 355 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.12 
 
 		 348 aa  175  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4042  ABC transporter related  43.75 
 
 		 360 aa  175  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  37.12 
 
 		 367 aa  175  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  40.48 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.82 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0454  ABC transporter-related protein  39.21 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.457213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.86 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  38.06 
 
 		 356 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  38.06 
 
 		 356 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  38.06 
 
 		 356 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  42.8 
 
 		 349 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  35.44 
 
 		 354 aa  172  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  44.61 
 
 		 357 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  34.7 
 
 		 385 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1284  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 		 289 aa  172  9e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3520  ATPase  46.39 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.6 
 
 		 376 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  43.36 
 
 		 386 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.36 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2357  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.95 
 
 		 343 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0369029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2257  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.86 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  42.08 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3947  ABC transporter-related protein  39.67 
 
 		 356 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.615077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.27 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  39.69 
 
 		 355 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.58 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.1 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1080  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.45 
 
 		 363 aa  169  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.16 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.58 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.12 
 
 		 357 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.34 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.41 
 
 		 349 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.11 
 
 		 369 aa  169  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  40.08 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 354 aa  168  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  40.08 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  41.35 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  45.32 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  39.7 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  40.08 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 1057 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  37.67 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  40.08 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  40.08 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.4 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  40.56 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.66 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.96 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.17 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  39.05 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  38.43 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.38 
 
 		 339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  36.86 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.65 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  43.46 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3201  ABC transporter component  45.13 
 
 		 359 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  42.55 
 
 		 351 aa  166  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7192  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.79 
 
 		 361 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1796  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 376 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356789  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0395  ABC transporter related  44.88 
 
 		 367 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.53 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>