More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1284 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1284  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
289 aa  570  1e-161  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0315  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  56.3 
 
 
284 aa  316  3e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.599525  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0360  molybdenum transport ATP-binding protein  55.8 
 
 
283 aa  301  1e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2281  RNA pseudouridine synthase  51.41 
 
 
285 aa  300  2e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0582  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  47.92 
 
 
291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1716  ABC transporter related protein  47.12 
 
 
286 aa  276  3e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.604131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  46.45 
 
 
289 aa  250  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  46.94 
 
 
309 aa  247  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0417  ABC transporter related  43.54 
 
 
301 aa  246  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  43.34 
 
 
302 aa  246  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  45.39 
 
 
289 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  41.72 
 
 
299 aa  235  8e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  43 
 
 
290 aa  226  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0454  ABC transporter-related protein  41.16 
 
 
301 aa  208  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.457213  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 
296 aa  203  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0345  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 
294 aa  203  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.127515  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2243  ABC transporter related  42.4 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  37.11 
 
 
314 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1739  ABC transporter related  46.15 
 
 
209 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.815071  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0211  ATPase  41.1 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0621  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 
348 aa  169  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0827201  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2257  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.11 
 
 
352 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 
352 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  39.22 
 
 
353 aa  168  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0701  sulfate ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 
348 aa  168  9e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 
367 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  36.89 
 
 
343 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  40.29 
 
 
339 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.72 
 
 
353 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3143  ABC transporter related  38.86 
 
 
275 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  39.81 
 
 
339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0682  ABC transporter-like protein  40.19 
 
 
337 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.67 
 
 
346 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.52 
 
 
346 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.71 
 
 
386 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0260  ABC transporter related  40.19 
 
 
632 aa  165  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.71 
 
 
336 aa  165  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.71 
 
 
386 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0442  putative iron ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
226 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.51 
 
 
346 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.18 
 
 
359 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  42.72 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  42.18 
 
 
386 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  39.83 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  39.5 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  39.22 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.46 
 
 
379 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  39.52 
 
 
357 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 
357 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  39.02 
 
 
337 aa  163  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  36.91 
 
 
378 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.92 
 
 
354 aa  163  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 
343 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  40.2 
 
 
343 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 
343 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0930  ABC transporter related protein  40.85 
 
 
318 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  38.79 
 
 
380 aa  162  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  41.23 
 
 
386 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1442  ABC transporter related  39.72 
 
 
315 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.57 
 
 
350 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  39.51 
 
 
349 aa  162  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1099  ABC transporter related  37.7 
 
 
327 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 
357 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  37.96 
 
 
328 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6603  ABC transporter related protein  38 
 
 
351 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.67 
 
 
354 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2777  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.94 
 
 
332 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.98 
 
 
340 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.76 
 
 
386 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  38.92 
 
 
377 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  37.5 
 
 
328 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1531  ABC transporter related  41.21 
 
 
211 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.952965  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 
366 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 
386 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2357  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.24 
 
 
343 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0369029  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.76 
 
 
386 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02515  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  40.09 
 
 
346 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1080  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.82 
 
 
363 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  38.7 
 
 
345 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  38.05 
 
 
387 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  37.93 
 
 
371 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  35.64 
 
 
373 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  39.71 
 
 
351 aa  159  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2078  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  36.06 
 
 
365 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.846917 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  39.22 
 
 
380 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0994  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.65 
 
 
376 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 
354 aa  159  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1096  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.65 
 
 
376 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  38.89 
 
 
330 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1333  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 
361 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.938281  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3295  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.61 
 
 
376 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.53786 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.95 
 
 
349 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  39.9 
 
 
352 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.73 
 
 
359 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  37.02 
 
 
328 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.28 
 
 
364 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.71 
 
 
338 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 
343 aa  158  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  39.53 
 
 
330 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>