More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2243 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2243  ABC transporter related  100 
 
 		 281 aa  579  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  52.23 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  46.25 
 
 		 290 aa  229  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  49.34 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  45.29 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0360  molybdenum transport ATP-binding protein  45.2 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0582  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  46.25 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  42.45 
 
 		 309 aa  215  7e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2281  RNA pseudouridine synthase  47.08 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  47.83 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0315  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  42.21 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.599525  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0345  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  43.53 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.127515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1442  ABC transporter related  49.28 
 
 		 315 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  46.79 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  43.53 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1284  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3143  ABC transporter related  49.23 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1716  ABC transporter related protein  46.06 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.604131  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0417  ABC transporter related  43.17 
 
 		 301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  47.89 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  46.8 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.75 
 
 		 357 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 		 353 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.5 
 
 		 372 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 		 385 aa  178  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 		 353 aa  178  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.79 
 
 		 348 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.23 
 
 		 370 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  41.96 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.61 
 
 		 356 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  46.73 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.63 
 
 		 359 aa  175  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.79 
 
 		 353 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.35 
 
 		 352 aa  175  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.39 
 
 		 353 aa  175  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  46.8 
 
 		 352 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  40.08 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  44.71 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44 
 
 		 373 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.27 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.27 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.79 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.27 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.59 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.12 
 
 		 356 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  46.8 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  39.35 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.27 
 
 		 387 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  44.71 
 
 		 527 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  40.28 
 
 		 380 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  40.76 
 
 		 380 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  43.78 
 
 		 353 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.27 
 
 		 377 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  43.58 
 
 		 353 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.27 
 
 		 377 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.27 
 
 		 378 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.27 
 
 		 377 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  39.11 
 
 		 364 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 		 377 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  44.86 
 
 		 329 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  43.58 
 
 		 353 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 		 377 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  46.31 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.27 
 
 		 378 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.27 
 
 		 377 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2941  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.27 
 
 		 388 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.52 
 
 		 345 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.31 
 
 		 378 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  41.23 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.83 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 		 390 aa  170  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  43.63 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 337 aa  169  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  43.93 
 
 		 329 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  41.44 
 
 		 344 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  43.93 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 		 377 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.83 
 
 		 387 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.83 
 
 		 382 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0191  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase component  40.87 
 
 		 368 aa  169  6e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  37.36 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0454  ABC transporter-related protein  39.37 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.457213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  37.02 
 
 		 360 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  44.39 
 
 		 346 aa  168  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  43.48 
 
 		 374 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  42.93 
 
 		 361 aa  168  7e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 378 aa  169  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2267  ABC transporter related protein  43.33 
 
 		 351 aa  168  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.06 
 
 		 370 aa  168  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  42.86 
 
 		 367 aa  168  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  38.07 
 
 		 1057 aa  168  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.35 
 
 		 402 aa  168  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.9 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 		 377 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  39.36 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.75 
 
 		 413 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  42.72 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.38 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.14 
 
 		 372 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>