More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0926 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  100 
 
 
290 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  51.72 
 
 
302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  48.97 
 
 
299 aa  295  4e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0345  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  51.2 
 
 
294 aa  295  7e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.127515  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  49.66 
 
 
289 aa  295  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  51.2 
 
 
296 aa  294  9e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  48.62 
 
 
289 aa  290  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  50 
 
 
309 aa  281  7.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0582  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  49.31 
 
 
291 aa  277  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2281  RNA pseudouridine synthase  49.48 
 
 
285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1716  ABC transporter related protein  46.88 
 
 
286 aa  256  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.604131  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0360  molybdenum transport ATP-binding protein  47.7 
 
 
283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0417  ABC transporter related  43.69 
 
 
301 aa  250  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  41.52 
 
 
314 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0315  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  45.67 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.599525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2243  ABC transporter related  46.25 
 
 
281 aa  229  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1284  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  43 
 
 
289 aa  226  3e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0454  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.457213  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1442  ABC transporter related  38.99 
 
 
315 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
274 aa  201  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3143  ABC transporter related  44.44 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3817  polyamine ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
382 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2088  ABC transporter related  45.45 
 
 
382 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.619396  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2664  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
384 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.75 
 
 
384 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1952  ABC transporter related  44.25 
 
 
382 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2398  ABC transporter  46.8 
 
 
384 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0142955  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2487  ABC transporter related  47.22 
 
 
379 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00872773  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1932  ABC transporter related  44.5 
 
 
382 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0195576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.92 
 
 
341 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  44.29 
 
 
380 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3450  ABC transporter related  42.92 
 
 
384 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622564  normal  0.365938 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  45.24 
 
 
380 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 
366 aa  186  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.1 
 
 
366 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  43.75 
 
 
349 aa  186  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0163  ABC transporter related  45.12 
 
 
383 aa  185  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283601  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.81 
 
 
372 aa  185  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.18 
 
 
373 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0330  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  44.29 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  42.57 
 
 
363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.41 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  42.79 
 
 
328 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.18 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.34 
 
 
604 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1606  ABC transporter related  41.13 
 
 
394 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256543  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.66 
 
 
370 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  42.79 
 
 
328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.34 
 
 
604 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4534  ABC transporter related  45.54 
 
 
365 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  39.68 
 
 
330 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.48 
 
 
337 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.58 
 
 
399 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.07 
 
 
388 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3591  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
330 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.07 
 
 
384 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.04 
 
 
386 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.14 
 
 
387 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.07 
 
 
384 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 
343 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.07 
 
 
384 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  38.75 
 
 
330 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4321  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.66 
 
 
363 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.412011 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 
353 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.44 
 
 
368 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2188  ABC transporter related  43.6 
 
 
331 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0854414 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  42.79 
 
 
343 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 
365 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.48 
 
 
386 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.78 
 
 
352 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.59 
 
 
354 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.07 
 
 
381 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 
353 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.13 
 
 
390 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  43.9 
 
 
376 aa  180  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 
330 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.64 
 
 
384 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.64 
 
 
384 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.71 
 
 
370 aa  180  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.48 
 
 
386 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.17 
 
 
356 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.22 
 
 
384 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  39.82 
 
 
342 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.48 
 
 
386 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.04 
 
 
386 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.48 
 
 
386 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.18 
 
 
354 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  38.19 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.59 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  44.17 
 
 
368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794001  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2813  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.64 
 
 
384 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  42.72 
 
 
339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  42.8 
 
 
384 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 
388 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0068  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 
376 aa  179  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
384 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
384 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3296  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.69 
 
 
364 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3812  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.69 
 
 
364 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>