More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3520 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3520  ATPase  100 
 
 
243 aa  497  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  46.91 
 
 
314 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  45.19 
 
 
213 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2041  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.94 
 
 
356 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1739  ABC transporter related  42.42 
 
 
209 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.815071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  47.39 
 
 
385 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0412  ABC transporter related  44.76 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00532109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.93 
 
 
359 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1442  ABC transporter related  46.39 
 
 
315 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  41.86 
 
 
368 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1380  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 
356 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.33894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 
385 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3696  ABC transporter related  41.12 
 
 
239 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3199  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  44.02 
 
 
363 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.951869  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4341  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 
374 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.884893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  40.51 
 
 
368 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
274 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1285  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  43.06 
 
 
362 aa  168  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  41.75 
 
 
380 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2975  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
362 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0469228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0507  ABC transporter related protein  50.28 
 
 
353 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0417  ABC transporter related  45.64 
 
 
301 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1923  ABC transporter related  43.9 
 
 
374 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142766  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1358  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  44.08 
 
 
374 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3143  ABC transporter related  40.95 
 
 
275 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0360  molybdenum transport ATP-binding protein  40.69 
 
 
283 aa  166  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1518  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  44.16 
 
 
376 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  44.71 
 
 
375 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  46.7 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  38.49 
 
 
369 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  44.34 
 
 
343 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2701  sulfate/thiosulfate transporter subunit  40.71 
 
 
365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2635  sulfate/thiosulfate transporter subunit  40.71 
 
 
365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2577  sulfate/thiosulfate transporter subunit  41.51 
 
 
365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  42.66 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2586  sulfate/thiosulfate transporter subunit  40.71 
 
 
365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2807  sulfate/thiosulfate transporter subunit  40.71 
 
 
365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  44.39 
 
 
373 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3531  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  43.59 
 
 
370 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1239  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.51 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.525663  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0345  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.61 
 
 
294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.127515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2677  sulfate/thiosulfate transporter subunit  40.71 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3652  sulfate/thiosulfate transporter subunit  41.51 
 
 
365 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.992152  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3545  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 
363 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0341777 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1257  sulfate/thiosulfate transporter subunit  41.51 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109195 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2558  sulfate/thiosulfate transporter subunit  41.51 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.61 
 
 
296 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02322  sulfate/thiosulfate transporter subunit  41.51 
 
 
365 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2943  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 
359 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  45.41 
 
 
338 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02283  hypothetical protein  41.51 
 
 
365 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2880  molybdate transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 
352 aa  162  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2794  sulfate/thiosulfate transporter subunit  41.04 
 
 
365 aa  162  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 
343 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3830  molybdate ABC transporter ATPase  43 
 
 
363 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 
357 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  40 
 
 
380 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  40.1 
 
 
380 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2758  ABC transporter:TOBE  39.91 
 
 
362 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394387  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2708  sulfate/thiosulfate transporter subunit  41.04 
 
 
365 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.882672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4395  ABC transporter-related protein  40.61 
 
 
369 aa  162  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  hitchhiker  0.0000262843 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  41.98 
 
 
363 aa  161  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2784  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  43.15 
 
 
359 aa  161  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000880352  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  41.07 
 
 
366 aa  161  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2948  sulfate/thiosulfate transporter subunit  42.5 
 
 
364 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.579552  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  40.95 
 
 
233 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1411  sulfate/thiosulfate transporter subunit  41.51 
 
 
363 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2578  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
261 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  41.51 
 
 
363 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0582  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  43.75 
 
 
291 aa  160  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0591  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 
233 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  39.2 
 
 
380 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  42.16 
 
 
373 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.5 
 
 
357 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  41.67 
 
 
289 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1579  ABC transporter related  40.76 
 
 
259 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  41 
 
 
357 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1940  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.04 
 
 
363 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.885935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  45.27 
 
 
247 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2243  ABC transporter related  41.45 
 
 
281 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3226  ABC transporter related  40.57 
 
 
247 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3755  ABC transporter related  40.57 
 
 
247 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.140303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 
351 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  40 
 
 
290 aa  159  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4786  ABC transporter related  39.3 
 
 
368 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00107272  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2860  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  42.13 
 
 
369 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3063  molybdate transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 
352 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0163  ABC transporter related  45.69 
 
 
383 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283601  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  38.79 
 
 
244 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.13 
 
 
356 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 
368 aa  159  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2472  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.18 
 
 
362 aa  158  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1179  molybdate transporter ATP-binding protein  39.71 
 
 
352 aa  158  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>