More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0412 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0412  ABC transporter related  100 
 
 
219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00532109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  66.19 
 
 
213 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1739  ABC transporter related  48.37 
 
 
209 aa  214  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.815071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4558  ABC transporter related  54.72 
 
 
222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0231  ABC-type transport system, ATPase component  52.09 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2578  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
261 aa  198  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3696  ABC transporter related  44.65 
 
 
239 aa  194  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 
233 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 
233 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 
233 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 
233 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 
233 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 
233 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 
233 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4068  ABC transporter related  48.54 
 
 
264 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  45.89 
 
 
380 aa  192  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2850  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  46.33 
 
 
233 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  45.19 
 
 
380 aa  190  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  46.53 
 
 
244 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0591  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  49.02 
 
 
233 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  47.06 
 
 
233 aa  188  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3226  ABC transporter related  47.52 
 
 
247 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3669  ABC transporter related  46.6 
 
 
233 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  44.93 
 
 
380 aa  187  7e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4506  ABC transporter related  46.6 
 
 
233 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3858  ABC transporter related  46.6 
 
 
233 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447489  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3755  ABC transporter related  47.29 
 
 
247 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.140303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  47.09 
 
 
233 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2477  ABC transporter related  43.78 
 
 
260 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4331  ABC transporter related  45.67 
 
 
247 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  0.0395621 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4221  ABC transporter related  45.67 
 
 
247 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2789  ABC transporter related  45.7 
 
 
253 aa  185  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6806  ABC transporter related  47.17 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000478564 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  46.83 
 
 
366 aa  182  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4403  ABC transporter related  47.89 
 
 
233 aa  181  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.193206  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  48.26 
 
 
336 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  48.26 
 
 
336 aa  180  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0632  ABC transporter related  45.05 
 
 
240 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225775  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 
385 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  43.98 
 
 
398 aa  178  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_003296  RS05462  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 
245 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.15 
 
 
359 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3520  ATPase  44.76 
 
 
243 aa  174  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 
368 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  42.86 
 
 
328 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  41.28 
 
 
360 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.28 
 
 
370 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0507  ABC transporter related protein  47.66 
 
 
353 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1481  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  44.08 
 
 
263 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.64 
 
 
402 aa  169  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4534  ABC transporter related  46.19 
 
 
365 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251009  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  45.59 
 
 
602 aa  169  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
367 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  45.13 
 
 
329 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1796  ABC transporter related  41.67 
 
 
393 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165895  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 
329 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1579  ABC transporter related  44.06 
 
 
259 aa  168  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  45.69 
 
 
330 aa  167  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 
353 aa  167  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  45.31 
 
 
355 aa  167  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  45.64 
 
 
329 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.29 
 
 
367 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2226  ABC transporter related  45.27 
 
 
222 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248839  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0415  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 
351 aa  167  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0892  ABC transporter related  42.92 
 
 
232 aa  167  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.494733  normal  0.0891232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  43.22 
 
 
329 aa  167  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.26 
 
 
359 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 
333 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.4 
 
 
378 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.9 
 
 
352 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  45.37 
 
 
527 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  44.12 
 
 
329 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1822  ABC transporter related  45.41 
 
 
370 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 
355 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
343 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.59 
 
 
331 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  41.47 
 
 
309 aa  165  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  43.9 
 
 
362 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  42.71 
 
 
333 aa  165  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.25 
 
 
353 aa  165  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.26 
 
 
353 aa  165  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.72 
 
 
372 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  42.79 
 
 
356 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.47 
 
 
329 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  45.36 
 
 
346 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  45.36 
 
 
346 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  45.36 
 
 
346 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  45.19 
 
 
352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1368  ABC transporter related  42.59 
 
 
385 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.101155 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2209  ABC transporter related  41.71 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0453823  normal  0.57752 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  43.6 
 
 
335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.55 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  43.59 
 
 
329 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  43.72 
 
 
385 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.26 
 
 
356 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1601  ABC transporter related protein  45.07 
 
 
358 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  40.19 
 
 
356 aa  162  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  44.33 
 
 
340 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  45 
 
 
354 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  42.56 
 
 
331 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>