More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2578 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2578  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
261 aa  532  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2850  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  59.45 
 
 
233 aa  265  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4403  ABC transporter related  59.36 
 
 
233 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.193206  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  62.21 
 
 
233 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  62.21 
 
 
233 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  62.21 
 
 
233 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  62.21 
 
 
233 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  62.21 
 
 
233 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  62.21 
 
 
233 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  62.21 
 
 
233 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6806  ABC transporter related  57.99 
 
 
233 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000478564 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0591  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  61.29 
 
 
233 aa  258  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05462  ABC transporter ATP-binding protein  55.79 
 
 
245 aa  255  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4221  ABC transporter related  55.46 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4331  ABC transporter related  55.46 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  0.0395621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3669  ABC transporter related  58.06 
 
 
233 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4506  ABC transporter related  58.06 
 
 
233 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3858  ABC transporter related  58.06 
 
 
233 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447489  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3226  ABC transporter related  53.39 
 
 
247 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3755  ABC transporter related  53.39 
 
 
247 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.140303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  54.08 
 
 
233 aa  248  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  58.06 
 
 
233 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2226  ABC transporter related  53 
 
 
222 aa  246  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248839  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0632  ABC transporter related  54.38 
 
 
240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  55.45 
 
 
244 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3696  ABC transporter related  50.23 
 
 
239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2789  ABC transporter related  49.79 
 
 
253 aa  211  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1579  ABC transporter related  50.45 
 
 
259 aa  201  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1481  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  48.37 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0412  ABC transporter related  50 
 
 
219 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00532109  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2477  ABC transporter related  48.64 
 
 
260 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4068  ABC transporter related  45.34 
 
 
264 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  47.52 
 
 
213 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0170  ABC transporter related  51.85 
 
 
258 aa  175  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  43.96 
 
 
366 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 
385 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0452  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  44.29 
 
 
350 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  36.98 
 
 
380 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  38.53 
 
 
309 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  40.47 
 
 
289 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  37.77 
 
 
380 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  40.55 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0507  ABC transporter related protein  48.11 
 
 
353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  47.69 
 
 
348 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  36.09 
 
 
380 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  47.09 
 
 
368 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1739  ABC transporter related  39.73 
 
 
209 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.815071  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 
368 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  45.33 
 
 
346 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3520  ATPase  41.63 
 
 
243 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  44.88 
 
 
356 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  45.89 
 
 
385 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4558  ABC transporter related  41.55 
 
 
222 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168786  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  45.33 
 
 
346 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2659  ABC transporter related  44.97 
 
 
374 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.44 
 
 
359 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  45.45 
 
 
362 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  43.16 
 
 
343 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.16 
 
 
343 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.16 
 
 
343 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.83 
 
 
367 aa  158  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.99 
 
 
378 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1484  ABC transporter related  41.18 
 
 
391 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.99 
 
 
378 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.99 
 
 
378 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.99 
 
 
378 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.99 
 
 
378 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  42.11 
 
 
363 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1441  ABC transporter related  38.5 
 
 
342 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
355 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
355 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
355 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
355 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  45.93 
 
 
247 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
355 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1601  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
358 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2631  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.33 
 
 
358 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
355 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  42.79 
 
 
363 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
374 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.31 
 
 
374 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5705  ABC transporter related  46.15 
 
 
366 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  41.28 
 
 
357 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.11 
 
 
344 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  46.32 
 
 
352 aa  155  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4448  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.24 
 
 
370 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3609  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.24 
 
 
370 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00717179  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3918  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.24 
 
 
370 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  47.09 
 
 
373 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  43.75 
 
 
370 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.97 
 
 
353 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1908  ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 
368 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3817  polyamine ABC transporter ATP-binding protein  42.79 
 
 
382 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0330  ABC transporter related protein  32.27 
 
 
349 aa  155  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5307  ABC transporter related  47.83 
 
 
355 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.853728 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  45.55 
 
 
405 aa  155  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45 
 
 
393 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 
353 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  44.86 
 
 
350 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 
353 aa  155  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>