More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0170 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0170  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  524  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2789  ABC transporter related  49.21 
 
 		 253 aa  231  9e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3696  ABC transporter related  49.32 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2477  ABC transporter related  50.66 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4221  ABC transporter related  52.4 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4331  ABC transporter related  52.4 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  0.0395621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1579  ABC transporter related  51.42 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2578  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1481  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  47.23 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4068  ABC transporter related  47.95 
 
 		 264 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2238  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  48.21 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27159  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0569  ABC transporter-related protein  48.05 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0328  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0297  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0632  ABC transporter related  44.12 
 
 		 240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225775  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0869  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1672  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441005  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2566  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1476  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.170992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2429  putative molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05462  ABC transporter ATP-binding protein  49.76 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2850  ABC molybdate transporter, ATPase subunit  47.51 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4506  ABC transporter related  47.77 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3669  ABC transporter related  47.77 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3858  ABC transporter related  47.77 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3226  ABC transporter related  47.27 
 
 		 247 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3755  ABC transporter related  47.32 
 
 		 247 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.140303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2226  ABC transporter related  50.95 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0591  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  49.53 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4887  ABC transporter related  48.39 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327201 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6806  ABC transporter related  46.15 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000478564 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4403  ABC transporter related  46.46 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.193206  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  46.57 
 
 		 366 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 385 aa  174  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1441  ABC transporter related  40.54 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3446  ABC transporter related  44.5 
 
 		 213 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0412  ABC transporter related  45.16 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00532109  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2939  ABC transporter ATP-binding protein  47.34 
 
 		 358 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.878604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3520  ATPase  42.08 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0256  ABC transporter related  39.01 
 
 		 367 aa  164  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1739  ABC transporter related  42.79 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.815071  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  47.87 
 
 		 355 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2869  ABC transporter related  46.03 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0665765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3216  ABC transporter related  45.5 
 
 		 361 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 		 356 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 356 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  40.64 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  38.53 
 
 		 289 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  43.69 
 
 		 356 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1484  ABC transporter related  35.74 
 
 		 391 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  44.66 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  44.66 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 355 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 355 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3947  ABC transporter-related protein  43.69 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.615077 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 355 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 355 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 355 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 355 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  46.28 
 
 		 355 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  40.85 
 
 		 380 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0507  ABC transporter related protein  47.28 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2176  ABC transporter related  41.82 
 
 		 398 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000568718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  46.28 
 
 		 355 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  46.28 
 
 		 355 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  46.28 
 
 		 355 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.39 
 
 		 615 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  40.96 
 
 		 357 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  43.63 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  40 
 
 		 380 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  46.28 
 
 		 355 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  42.27 
 
 		 352 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4452  ABC transporter related  41.36 
 
 		 380 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  38.07 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4558  ABC transporter related  42.86 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168786  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 		 604 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 		 356 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  44.39 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1796  ABC transporter related  45.36 
 
 		 393 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165895  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.41 
 
 		 413 aa  151  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1601  ABC transporter related protein  43 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.73 
 
 		 359 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 		 330 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  42.55 
 
 		 363 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  36.7 
 
 		 289 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.03 
 
 		 604 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1368  ABC transporter related  38.7 
 
 		 385 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.101155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1308  ABC transporter related  41.87 
 
 		 353 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0582  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  38.36 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1063  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.98 
 
 		 376 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  42.33 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.36 
 
 		 367 aa  148  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0231  ABC-type transport system, ATPase component  42.65 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4341  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.73 
 
 		 374 aa  148  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.884893 
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 368 aa  148  8e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.98 
 
 		 376 aa  148  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  37.55 
 
 		 314 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  34.55 
 
 		 309 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  40.19 
 
 		 356 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>