More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4452 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4452  ABC transporter related  100 
 
 		 380 aa  765    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.18 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  40.78 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  42.16 
 
 		 353 aa  259  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  54.32 
 
 		 375 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  45.74 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  44.59 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  41.78 
 
 		 353 aa  250  4e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  43.17 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  52.44 
 
 		 384 aa  249  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.55 
 
 		 355 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 377 aa  246  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  50.66 
 
 		 363 aa  246  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  48.18 
 
 		 346 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  49.79 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1841  ABC transporter related  40.18 
 
 		 361 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  50.87 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6023  ABC transporter-related protein  40.47 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  48.18 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  42.63 
 
 		 382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  38.59 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  49.38 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3225  ABC transporter related  38.89 
 
 		 373 aa  242  7.999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  45.69 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.35 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  40.43 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  38.32 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  43.92 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.82 
 
 		 353 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  38.74 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  38.61 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.84 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40 
 
 		 382 aa  240  4e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  46.83 
 
 		 367 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.23 
 
 		 363 aa  240  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  51.3 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 376 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 353 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0542  ABC transporter related  48.55 
 
 		 346 aa  239  8e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.999499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  50 
 
 		 352 aa  239  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  39.84 
 
 		 352 aa  238  9e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  43.82 
 
 		 330 aa  238  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  44 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.34 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  48.35 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  48.76 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  36.97 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.58 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  37.05 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  50.45 
 
 		 410 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  48.94 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  49.56 
 
 		 353 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  49.32 
 
 		 329 aa  237  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.56 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  41.05 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.95 
 
 		 364 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.56 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3666  ABC transporter related  41.18 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  36.48 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  47.15 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5537  ABC transporter related  42.86 
 
 		 366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  48.57 
 
 		 353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1655  ABC transporter related  49.61 
 
 		 361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  42.91 
 
 		 368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  40.66 
 
 		 350 aa  236  5.0000000000000005e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  49.78 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  50.43 
 
 		 341 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 340 aa  236  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  46.89 
 
 		 367 aa  235  7e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  46.89 
 
 		 367 aa  235  7e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.25 
 
 		 373 aa  235  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  48.16 
 
 		 353 aa  235  8e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  43.51 
 
 		 372 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  39.21 
 
 		 354 aa  235  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.18 
 
 		 382 aa  235  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4866  ABC transporter related  40.92 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.112341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1719  ABC transporter related  45.23 
 
 		 364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  38.79 
 
 		 353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  49.38 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  43.51 
 
 		 372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  47.15 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.78 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0435  ABC transporter related  48.43 
 
 		 453 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  43.1 
 
 		 389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.38 
 
 		 352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  42.41 
 
 		 356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  40.58 
 
 		 353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  36.97 
 
 		 349 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  39.16 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  42.7 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  45.08 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  41.03 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2941  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.72 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  40.88 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  45.67 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.56 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  45.32 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>