More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5705 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5705  ABC transporter related  100 
 
 		 366 aa  736    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  49.06 
 
 		 375 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  50.96 
 
 		 370 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  49.73 
 
 		 369 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  49.47 
 
 		 369 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.06 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.06 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.06 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.06 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.06 
 
 		 370 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  49.06 
 
 		 370 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  49.6 
 
 		 369 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  49.18 
 
 		 376 aa  342  8e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  49.18 
 
 		 380 aa  341  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  50.41 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  49.33 
 
 		 369 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.06 
 
 		 388 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  50.68 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  49.87 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  49.87 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  48.08 
 
 		 372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  48.91 
 
 		 369 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  47.47 
 
 		 368 aa  338  7e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  50.54 
 
 		 370 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  48.91 
 
 		 361 aa  338  9e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  50 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  50.42 
 
 		 353 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  47.54 
 
 		 379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  50.69 
 
 		 354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  48.4 
 
 		 369 aa  335  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  50 
 
 		 353 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.14 
 
 		 369 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.79 
 
 		 370 aa  334  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  46.88 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  49.04 
 
 		 369 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  51.79 
 
 		 355 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  51.32 
 
 		 360 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  50.87 
 
 		 361 aa  332  6e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  50.56 
 
 		 355 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  50.69 
 
 		 353 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  49.87 
 
 		 366 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  48.39 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  49.04 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  50 
 
 		 352 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  49.32 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  49.73 
 
 		 352 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  49.73 
 
 		 366 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  48.63 
 
 		 371 aa  329  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  61.63 
 
 		 332 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  47.63 
 
 		 358 aa  328  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  47.91 
 
 		 358 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  48.48 
 
 		 361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  48.47 
 
 		 334 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  50.42 
 
 		 358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  49.44 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  48.75 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  62.96 
 
 		 332 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  49.72 
 
 		 356 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5140  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  48.47 
 
 		 360 aa  325  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0880635  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  48.9 
 
 		 350 aa  325  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.7 
 
 		 335 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  49.18 
 
 		 349 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  46.96 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  63.22 
 
 		 332 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  52.16 
 
 		 367 aa  325  9e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  47.92 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  47.95 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.28 
 
 		 349 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  51.08 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.28 
 
 		 349 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 368 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 351 aa  323  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.9 
 
 		 351 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  44.69 
 
 		 368 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  61.26 
 
 		 332 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  48.21 
 
 		 349 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  48.22 
 
 		 371 aa  322  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  52.37 
 
 		 361 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  60.47 
 
 		 334 aa  322  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  49.04 
 
 		 355 aa  322  6e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  53.33 
 
 		 361 aa  322  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  45.11 
 
 		 366 aa  322  6e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  47.66 
 
 		 357 aa  322  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  60.48 
 
 		 332 aa  322  7e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  55.13 
 
 		 357 aa  322  7e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  61.26 
 
 		 332 aa  322  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  47.27 
 
 		 391 aa  322  8e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  45.53 
 
 		 353 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  52.13 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  50 
 
 		 369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  50.28 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  49.16 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  48.33 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  47.79 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.23 
 
 		 369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  50.28 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  48.19 
 
 		 334 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  61.41 
 
 		 332 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  61.94 
 
 		 332 aa  320  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  47.63 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>