More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4395 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  86.38 
 
 		 368 aa  657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4786  ABC transporter related  88.32 
 
 		 368 aa  668    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00107272  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4395  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 369 aa  756    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  hitchhiker  0.0000262843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  81.47 
 
 		 369 aa  624  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0287  ABC transporter related  75.2 
 
 		 367 aa  577  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0283  ABC transporter related  74.93 
 
 		 367 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0280  ABC transporter related  74.93 
 
 		 367 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000359187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0279  ABC transporter related  74.39 
 
 		 367 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000167644 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3742  ABC transporter related  74.39 
 
 		 367 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0395  ABC transporter related  74.66 
 
 		 367 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0290  ABC transporter related  74.93 
 
 		 367 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4446  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  74.11 
 
 		 367 aa  570  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  73.84 
 
 		 367 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3531  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  68.42 
 
 		 370 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  67.58 
 
 		 373 aa  512  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  56.8 
 
 		 375 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1923  ABC transporter related  42.27 
 
 		 374 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1393  ABC transporter related  43.21 
 
 		 350 aa  256  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  38.11 
 
 		 368 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  48.93 
 
 		 241 aa  216  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0163  ABC transporter related  40.36 
 
 		 383 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  34.49 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  39.22 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  39.22 
 
 		 380 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  38.49 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  42.51 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1571  ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  45.13 
 
 		 333 aa  192  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 330 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  46.75 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.76 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1822  ABC transporter related  37.68 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5129  ABC transporter related  44.58 
 
 		 370 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  44.44 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 		 333 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  41.47 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  37.46 
 
 		 365 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  44.25 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 330 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.74 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 343 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3591  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.92 
 
 		 374 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.27 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  37.18 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4252  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.07 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  41.13 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.03 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  41.81 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  36.53 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0101  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 366 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.22 
 
 		 375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.34 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.49 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  44.78 
 
 		 360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  47.14 
 
 		 359 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.35 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0320  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  41.39 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0465  ABC transporter related  43.24 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.365708  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2499  ABC transporter related  40.38 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  35.71 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  41.23 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.8 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.25 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0082  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  40.89 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  39.62 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.74 
 
 		 357 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 365 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1796  ABC transporter related  41.49 
 
 		 393 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165895  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.6 
 
 		 357 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.54 
 
 		 369 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.54 
 
 		 369 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.55 
 
 		 362 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  40.97 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  37.58 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.56 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  40.59 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  42.32 
 
 		 353 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.79 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  44.05 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.78 
 
 		 360 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  31.44 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.55 
 
 		 363 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.68 
 
 		 346 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  42.69 
 
 		 362 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>