More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5129 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5129  ABC transporter related  100 
 
 
370 aa  743    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701996  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  81.2 
 
 
387 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  79.89 
 
 
413 aa  598  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  51.22 
 
 
364 aa  328  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4042  ABC transporter related  45.85 
 
 
360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643948  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7192  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 
361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27359  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.34 
 
 
378 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  46.75 
 
 
364 aa  276  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  47 
 
 
363 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.97 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.56 
 
 
363 aa  272  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  46.37 
 
 
363 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  44.25 
 
 
356 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 
363 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  46.67 
 
 
360 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  46.67 
 
 
360 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0982  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.89 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.68 
 
 
368 aa  268  8e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.9 
 
 
380 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6838  putrescine ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 
393 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.840617  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.51 
 
 
381 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  47.63 
 
 
371 aa  267  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.81 
 
 
381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.9 
 
 
380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661243  hitchhiker  0.000000930284 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  44.57 
 
 
356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.26 
 
 
380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  45.6 
 
 
360 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  45.6 
 
 
360 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.16 
 
 
381 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  44.87 
 
 
356 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.77 
 
 
373 aa  265  8e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  45.71 
 
 
360 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  46.69 
 
 
366 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.66 
 
 
402 aa  264  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  46.71 
 
 
359 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4639  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.19 
 
 
380 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.21 
 
 
400 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.27 
 
 
379 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  45.66 
 
 
356 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.23 
 
 
382 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  43.96 
 
 
363 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  46.25 
 
 
353 aa  262  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
342 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.63 
 
 
382 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  43.16 
 
 
377 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.16 
 
 
377 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.16 
 
 
377 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0820  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  43.38 
 
 
382 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  46.5 
 
 
527 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  43.16 
 
 
377 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.81 
 
 
372 aa  261  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.16 
 
 
377 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.16 
 
 
377 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.16 
 
 
377 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.16 
 
 
377 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  43.96 
 
 
359 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1366  putative putrescine transport ATP-binding protein  43.77 
 
 
373 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.82 
 
 
356 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.77 
 
 
377 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.67 
 
 
382 aa  261  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.81 
 
 
377 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.07 
 
 
377 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
355 aa  260  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.88 
 
 
372 aa  260  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.3 
 
 
388 aa  260  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.05 
 
 
343 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4874  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.49 
 
 
360 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.368971 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  40.67 
 
 
359 aa  259  4e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  41.78 
 
 
368 aa  259  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
377 aa  259  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  41.88 
 
 
364 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.95 
 
 
369 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  47.18 
 
 
359 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.82 
 
 
356 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.93 
 
 
377 aa  259  7e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.93 
 
 
377 aa  259  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.69 
 
 
355 aa  259  7e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.53 
 
 
353 aa  259  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.93 
 
 
377 aa  259  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
354 aa  258  8e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2941  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.49 
 
 
388 aa  258  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  42.33 
 
 
371 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.77 
 
 
358 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.09 
 
 
359 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.81 
 
 
383 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  49.61 
 
 
327 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  49.61 
 
 
331 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  49.61 
 
 
331 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  49.61 
 
 
327 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  49.61 
 
 
327 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  49.61 
 
 
331 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 
369 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.81 
 
 
374 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  49.61 
 
 
331 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.52 
 
 
426 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.57 
 
 
381 aa  256  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.54 
 
 
408 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.29 
 
 
375 aa  256  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.25 
 
 
345 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.46 
 
 
349 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>