More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4786 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4786  ABC transporter related  100 
 
 		 368 aa  754    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00107272  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  84.2 
 
 		 368 aa  638    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4395  ABC transporter-related protein  88.32 
 
 		 369 aa  668    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  hitchhiker  0.0000262843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  80.93 
 
 		 369 aa  614  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0395  ABC transporter related  74.93 
 
 		 367 aa  567  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0283  ABC transporter related  74.66 
 
 		 367 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0290  ABC transporter related  74.66 
 
 		 367 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  73.84 
 
 		 367 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0287  ABC transporter related  74.39 
 
 		 367 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0279  ABC transporter related  73.57 
 
 		 367 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000167644 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3742  ABC transporter related  73.3 
 
 		 367 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0280  ABC transporter related  73.57 
 
 		 367 aa  559  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000359187 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4446  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  73.02 
 
 		 367 aa  554  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3531  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  68.98 
 
 		 370 aa  519  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  67.13 
 
 		 373 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  56.4 
 
 		 375 aa  292  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1393  ABC transporter related  45.43 
 
 		 350 aa  263  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1923  ABC transporter related  42.38 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  36.76 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  35.12 
 
 		 385 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0163  ABC transporter related  39.4 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  47.64 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  38.82 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  36.93 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  38.82 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  43.12 
 
 		 384 aa  189  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.59 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5129  ABC transporter related  44.18 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  44.25 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  41.81 
 
 		 349 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  44.98 
 
 		 309 aa  186  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  41.3 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.74 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.41 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1571  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 330 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.52 
 
 		 359 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 330 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1822  ABC transporter related  37.97 
 
 		 370 aa  183  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.23 
 
 		 356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.13 
 
 		 357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  41.13 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 333 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  40.72 
 
 		 330 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 318 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 318 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 330 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 333 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 330 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  41.59 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  43.81 
 
 		 333 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  35.43 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  45.29 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.18 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  45.02 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.87 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  37.09 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  44.1 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3591  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.87 
 
 		 369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.13 
 
 		 353 aa  180  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  37.65 
 
 		 357 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.13 
 
 		 413 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.33 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  35.5 
 
 		 372 aa  179  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.85 
 
 		 367 aa  179  7e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  42.61 
 
 		 352 aa  179  9e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  40.98 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4252  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.3 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  41.83 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.08 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.25 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0256  ABC transporter related  38.08 
 
 		 367 aa  178  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  43.1 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  43.67 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0480  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.380104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  45.5 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  33.14 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  42.99 
 
 		 338 aa  177  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  44.44 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.12 
 
 		 345 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1935  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.04 
 
 		 357 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786432  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  38.08 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  48.18 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.23 
 
 		 354 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  41.03 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.13 
 
 		 426 aa  176  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.78 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.22 
 
 		 375 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.22 
 
 		 375 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4355  ABC transporter related  43.04 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 363 aa  176  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.24 
 
 		 372 aa  176  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  38.41 
 
 		 387 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0101  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 366 aa  176  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>