More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2975 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2975  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
362 aa  728    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0469228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2758  ABC transporter:TOBE  88.4 
 
 
362 aa  653    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394387  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2943  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  72.91 
 
 
359 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40420  molybdenum transport protein ModC  72.07 
 
 
361 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3429  molybdenum transporter  71.23 
 
 
361 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3545  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  66.39 
 
 
363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0341777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3830  molybdate ABC transporter ATPase  65.84 
 
 
363 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1940  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  65.84 
 
 
363 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.885935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3199  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  66.39 
 
 
363 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.951869  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4341  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  61.73 
 
 
374 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.884893 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  60.89 
 
 
380 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0538  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  59.78 
 
 
382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2784  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  58.29 
 
 
359 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000880352  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2886  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  57.42 
 
 
365 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224709  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2041  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  55.59 
 
 
356 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1380  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  54.9 
 
 
356 aa  378  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.33894  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1358  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  57.99 
 
 
374 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2472  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  56.42 
 
 
362 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1285  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  55.87 
 
 
362 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3126  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  53.89 
 
 
364 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1518  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  54.04 
 
 
376 aa  361  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2860  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 
369 aa  361  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2026  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  56.23 
 
 
369 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3547  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50.98 
 
 
359 aa  335  7e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2847  Fis family transcriptional regulator  49.56 
 
 
362 aa  323  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.801807  normal  0.896227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0977  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.85 
 
 
379 aa  322  7e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1570  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  49.02 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.849947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0859  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  49.71 
 
 
377 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01280  ABC transporter, membrane spanning protein  47.83 
 
 
364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0186  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  49.86 
 
 
355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1183  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.38 
 
 
362 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286566  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0965  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  46.57 
 
 
376 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5196  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.03 
 
 
373 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4315  hypothetical protein  49.28 
 
 
362 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2078  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
365 aa  279  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.846917 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3880  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.59 
 
 
355 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314115  decreased coverage  0.00984217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0708  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  48.06 
 
 
381 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  0.208923 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3063  molybdate transporter ATP-binding protein  46.18 
 
 
352 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03849  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 
352 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.88 
 
 
355 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1271  molybdate transporter ATP-binding protein  45.88 
 
 
352 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01580  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
358 aa  262  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 
370 aa  262  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2880  molybdate transporter ATP-binding protein  44.57 
 
 
352 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  43.58 
 
 
365 aa  259  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1305  molybdate transporter ATP-binding protein  44.97 
 
 
355 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1179  molybdate transporter ATP-binding protein  44.25 
 
 
352 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1421  molybdate transporter ATP-binding protein  44.61 
 
 
359 aa  256  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2935  molybdate transporter ATP-binding protein  44.61 
 
 
359 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2848  molybdate transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2675  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 
364 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586715  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3869  ABC molybdate transporter, ATPase subunit ModC  45.13 
 
 
368 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340875  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3483  molybdenum import ATP-binding protein modC  42.58 
 
 
360 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05727  molybdate transporter ATP-binding protein  41 
 
 
368 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000119  molybdenum transport ATP-binding protein ModC  41.05 
 
 
368 aa  249  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40487  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4171  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  44.85 
 
 
368 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00841959  normal  0.195843 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0090  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 
359 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.508509  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3711  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.79 
 
 
358 aa  245  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5516  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.9 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.929695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0910  molybdate transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0933  molybdate transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 
352 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.295705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0878  molybdate transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 
352 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0847  molybdate transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 
352 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0819  molybdate transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 
352 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4252  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.08 
 
 
359 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0264287  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0780  molybdate transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 
363 aa  238  9e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.204201  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1256  molybdate transporter ATP-binding protein  43.7 
 
 
352 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0060  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  44.06 
 
 
362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.400858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2468  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  43.33 
 
 
354 aa  235  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0196749 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2877  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 
352 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0819  molybdate transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 
352 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0792  molybdate transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 
352 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0868  molybdate transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 
352 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.661527  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2897  molybdate transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 
352 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000164912  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0686  molybdate transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 
352 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.066647  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0663  molybdate transporter ATP-binding protein  40.06 
 
 
366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0788  molybdate transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 
352 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3918  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.06 
 
 
364 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3662  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  41.85 
 
 
363 aa  230  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
367 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1925  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  39.83 
 
 
358 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3635  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.46 
 
 
364 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2823  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  44.32 
 
 
357 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.623728 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2328  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.21 
 
 
367 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1629  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.65 
 
 
368 aa  225  8e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0796  molybdate transporter ATP-binding protein  37.88 
 
 
361 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19538  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0821  molybdate transporter ATP-binding protein  38.68 
 
 
361 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0807  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.29 
 
 
369 aa  225  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3727  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.3 
 
 
367 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2720  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.64 
 
 
357 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118239  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3540  molybdate transporter ATP-binding protein  38.11 
 
 
361 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0828  molybdate transporter ATP-binding protein  38.97 
 
 
361 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216201  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0741  molybdate transporter ATP-binding protein  38.74 
 
 
361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3197  molybdate transporter ATP-binding protein  37.36 
 
 
361 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0432281  hitchhiker  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2541  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  44.54 
 
 
372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0767  molybdate transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 
361 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3865  molybdate transporter ATP-binding protein  38.16 
 
 
361 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3928  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.46 
 
 
364 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2667  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.17 
 
 
351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0993719  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4641  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 
379 aa  212  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.649423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>