More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0060 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0060  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
362 aa  716    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.400858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  58.15 
 
 
367 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.31 
 
 
355 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3880  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  46.59 
 
 
355 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314115  decreased coverage  0.00984217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3727  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.25 
 
 
367 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3869  ABC molybdate transporter, ATPase subunit ModC  45.22 
 
 
368 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340875  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2935  molybdate transporter ATP-binding protein  45.58 
 
 
359 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1421  molybdate transporter ATP-binding protein  45.58 
 
 
359 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4171  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  44.94 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00841959  normal  0.195843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2848  molybdate transporter ATP-binding protein  45.03 
 
 
359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2328  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50.56 
 
 
367 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2541  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.09 
 
 
372 aa  269  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2823  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.32 
 
 
357 aa  268  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.623728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1305  molybdate transporter ATP-binding protein  45.4 
 
 
355 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3918  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  49.29 
 
 
364 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2880  molybdate transporter ATP-binding protein  46.63 
 
 
352 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 
365 aa  263  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3635  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.73 
 
 
364 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1179  molybdate transporter ATP-binding protein  43.66 
 
 
352 aa  258  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1271  molybdate transporter ATP-binding protein  43.42 
 
 
352 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3711  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.29 
 
 
358 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1358  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 
374 aa  256  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3063  molybdate transporter ATP-binding protein  43.14 
 
 
352 aa  256  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5516  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48 
 
 
358 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.929695 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4252  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.56 
 
 
359 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0264287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2720  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.62 
 
 
357 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0538  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.02 
 
 
382 aa  253  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  42.24 
 
 
380 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3928  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.73 
 
 
364 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0741  molybdate transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 
361 aa  250  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  42.82 
 
 
370 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4341  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.14 
 
 
374 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.884893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0767  molybdate transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 
361 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05727  molybdate transporter ATP-binding protein  39.39 
 
 
368 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40420  molybdenum transport protein ModC  42.65 
 
 
361 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3197  molybdate transporter ATP-binding protein  42.14 
 
 
361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0432281  hitchhiker  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3429  molybdenum transporter  42.94 
 
 
361 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0663  molybdate transporter ATP-binding protein  42.58 
 
 
366 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000119  molybdenum transport ATP-binding protein ModC  40.52 
 
 
368 aa  239  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40487  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0859  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  44.32 
 
 
377 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3199  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.77 
 
 
363 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.951869  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3483  molybdenum import ATP-binding protein modC  41.91 
 
 
360 aa  239  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0821  molybdate transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 
361 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3865  molybdate transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 
361 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0796  molybdate transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 
361 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19538  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3830  molybdate ABC transporter ATPase  42.77 
 
 
363 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2758  ABC transporter:TOBE  43.48 
 
 
362 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394387  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2975  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  44.06 
 
 
362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0469228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0828  molybdate transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 
361 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216201  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3662  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  43.38 
 
 
363 aa  235  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0780  molybdate transporter ATP-binding protein  39.61 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.204201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3540  molybdate transporter ATP-binding protein  39.72 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212575  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3545  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.49 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0341777 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2667  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.42 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0993719  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0090  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 
359 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.508509  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2041  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.24 
 
 
356 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1518  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.59 
 
 
376 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0910  molybdate transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 
352 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1940  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.49 
 
 
363 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.885935 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2877  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.58 
 
 
352 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0878  molybdate transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 
352 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2897  molybdate transporter ATP-binding protein  42.58 
 
 
352 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000164912  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0819  molybdate transporter ATP-binding protein  42.58 
 
 
352 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2847  Fis family transcriptional regulator  41.49 
 
 
362 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.801807  normal  0.896227 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0933  molybdate transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 
352 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.295705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0847  molybdate transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 
352 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0868  molybdate transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 
352 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.661527  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0792  molybdate transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 
352 aa  230  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0686  molybdate transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 
352 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.066647  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0819  molybdate transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 
352 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2784  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  41.29 
 
 
359 aa  229  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000880352  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0788  molybdate transporter ATP-binding protein  42.13 
 
 
352 aa  229  8e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1285  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  42.33 
 
 
362 aa  227  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1570  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.5 
 
 
356 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.849947  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1256  molybdate transporter ATP-binding protein  42.02 
 
 
352 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2943  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  40.9 
 
 
359 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01280  ABC transporter, membrane spanning protein  39.72 
 
 
364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2078  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 
365 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.846917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5196  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.61 
 
 
373 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1380  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 
356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.33894  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0965  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 
376 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3126  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.55 
 
 
364 aa  223  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4315  hypothetical protein  42.5 
 
 
362 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2886  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.19 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224709  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2860  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3547  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.94 
 
 
359 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2472  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.66 
 
 
362 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0452  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.18 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2675  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  39.72 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3321  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.41 
 
 
351 aa  212  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0708  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 
381 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  0.208923 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1925  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  39.83 
 
 
358 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0186  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 
355 aa  210  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0977  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.51 
 
 
379 aa  209  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2611  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.71 
 
 
351 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02320  molybdenum import ATP-binding protein ModC  51.71 
 
 
204 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223411  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3715  ABC type ATPase  42.65 
 
 
376 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1183  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.45 
 
 
362 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286566  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1618  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.15 
 
 
351 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0777  ABC-type transport system, ATPase component  33.81 
 
 
351 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000465044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>