More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5196 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5196  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 373 aa  740    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0965  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  79.13 
 
 		 376 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0859  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  79.67 
 
 		 377 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0708  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  74.66 
 
 		 381 aa  524  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.18937  normal  0.208923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2078  molybdenum ABC transporter ATP-binding protein  59.78 
 
 		 365 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.846917 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4315  hypothetical protein  58.38 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1358  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  52.26 
 
 		 374 aa  322  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2041  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  49.44 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1183  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.19 
 
 		 362 aa  309  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286566  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  49.58 
 
 		 380 aa  302  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1285  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  50.42 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0186  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50.28 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1380  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.33894  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2943  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  47.24 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2472  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  50.14 
 
 		 362 aa  296  5e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3126  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.89 
 
 		 364 aa  294  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01280  ABC transporter, membrane spanning protein  46.81 
 
 		 364 aa  292  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1518  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.42 
 
 		 376 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1570  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  49.28 
 
 		 356 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.849947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3830  molybdate ABC transporter ATPase  49.01 
 
 		 363 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3429  molybdenum transporter  46.69 
 
 		 361 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4341  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.09 
 
 		 374 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.884893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1940  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  49.01 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.885935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40420  molybdenum transport protein ModC  46.41 
 
 		 361 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3547  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.33 
 
 		 359 aa  282  7.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2975  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0469228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0977  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2784  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000880352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2847  Fis family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.801807  normal  0.896227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2886  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.22 
 
 		 365 aa  278  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224709  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0538  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.63 
 
 		 382 aa  278  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2860  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  47.22 
 
 		 369 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2758  ABC transporter:TOBE  45.33 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394387  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3545  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.43 
 
 		 363 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0341777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3199  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  48.73 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.951869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3869  ABC molybdate transporter, ATPase subunit ModC  47.41 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340875  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4171  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  47.14 
 
 		 368 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00841959  normal  0.195843 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2667  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.18 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0993719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.2 
 
 		 355 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3880  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.2 
 
 		 355 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314115  decreased coverage  0.00984217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2026  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.68 
 
 		 369 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0821  molybdate transporter ATP-binding protein  40.06 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0741  molybdate transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 		 361 aa  243  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0796  molybdate transporter ATP-binding protein  41.13 
 
 		 361 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0828  molybdate transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 		 361 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216201  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0767  molybdate transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0663  molybdate transporter ATP-binding protein  42.15 
 
 		 366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3197  molybdate transporter ATP-binding protein  39.72 
 
 		 361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0432281  hitchhiker  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3483  molybdenum import ATP-binding protein modC  43.02 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3540  molybdate transporter ATP-binding protein  39.44 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1179  molybdate transporter ATP-binding protein  39.5 
 
 		 352 aa  233  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3865  molybdate transporter ATP-binding protein  39.72 
 
 		 361 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03849  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01580  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2880  molybdate transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 352 aa  228  9e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3711  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.91 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0702  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  44.07 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1271  molybdate transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 		 352 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05727  molybdate transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2935  molybdate transporter ATP-binding protein  41.57 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1421  molybdate transporter ATP-binding protein  41.57 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3063  molybdate transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 		 352 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5516  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.91 
 
 		 358 aa  226  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.929695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2468  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  44.16 
 
 		 354 aa  226  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196749 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2848  molybdate transporter ATP-binding protein  41.29 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0060  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.61 
 
 		 362 aa  224  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.400858 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3662  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  42.82 
 
 		 363 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000119  molybdenum transport ATP-binding protein ModC  37.33 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2328  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.95 
 
 		 367 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1581  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  52.26 
 
 		 254 aa  219  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1305  molybdate transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 		 355 aa  219  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2675  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  39.95 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586715  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0780  molybdate transporter ATP-binding protein  38.89 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.204201  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2720  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.39 
 
 		 357 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118239  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2282  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.04 
 
 		 367 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1629  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 		 368 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2541  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  44.01 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1925  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  39.72 
 
 		 358 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2823  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.82 
 
 		 357 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.623728 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3715  ABC type ATPase  44.32 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0090  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  41.62 
 
 		 359 aa  210  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.508509  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4252  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.18 
 
 		 359 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0264287  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3635  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 		 364 aa  206  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3727  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.34 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3918  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.47 
 
 		 364 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0653533  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0807  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.07 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  38.95 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0910  molybdate transporter ATP-binding protein  38.66 
 
 		 352 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0878  molybdate transporter ATP-binding protein  38.66 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0933  molybdate transporter ATP-binding protein  38.66 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.295705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3928  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.47 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0847  molybdate transporter ATP-binding protein  38.38 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2164  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  32.74 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0819  molybdate transporter ATP-binding protein  38.66 
 
 		 352 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2897  molybdate transporter ATP-binding protein  38.89 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000164912  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0868  molybdate transporter ATP-binding protein  38.89 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.661527  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0819  molybdate transporter ATP-binding protein  38.89 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0686  molybdate transporter ATP-binding protein  38.89 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.066647  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0792  molybdate transporter ATP-binding protein  38.89 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0788  molybdate transporter ATP-binding protein  38.89 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>